年前，華北地區溫度進一步下降，在冰期中的氣候變冷是比較頻繁的。而這是第四紀冰期最後的寒冷時期，黃河流域的各部落處于收縮時期。溫暖的長江流域範圍内的巢湖流域的有巢氏部落興盛起來。
有巢氏的首領（姑且命名爲有巢）出生在湖南九嶷山以南的蒼梧，成年之前一直是在各地流浪的孤兒，由于從小颠沛流離，所以體格非常壯碩。在流浪到巢湖流域的淩家灘時，被招贅入當地部落（當時由于盤古的要求，當時婚姻已經實行母系氏族的外婚制，而不再是原始人群的内婚制）。
之前說過長江流域很難挖洞，所以人口發展緩慢。隻能呆在少數的山洞中生活。有巢因爲部落中的人們經常受到蛇蟲鼠蟻的滋擾，開始想方設法解決這些困擾人類的問題。因爲在流浪的過程中，受鳥類在樹上築巢的啓發，研究出了鳥類築巢的枝條編織方法以及稀泥彌縫的方法，算是中國最早的木匠，今天所有的木匠技術都來自于這種枝條編織的方法。
有巢想能不能利用這種方法在樹上搭建類似鳥巢的“人巢”呢？有巢開始試驗，并且經過長年的努力終于成功了。有巢指導族人用樹枝和藤條在高大的樹幹上建造房屋，房屋的四壁和屋頂都用樹枝遮擋得嚴嚴實實，并且用泥彌縫。既擋風避雨，又可防禽獸的攻擊，人們從此不再過那種擔驚受怕的日子。
後來人們将其發揚光大，以木樁做基礎，上架闆台，闆台架空于地面。闆台上立柱、作牆、蓋頂，成爲茅屋。栖息在木樁上的茅屋，也就是“構木爲巢”了。在上面可以躲避禽獸。不要小看這個巢，它最令人驚歎之處在于，木樁之間是通過榫卯結構連接（就像現在的椅子那樣，以方孔和方栓把兩根木杠咬合一起）。在金屬工具出現以前的石器時代，作出這種榫卯結構的巢無疑是空前奇迹。
巢上面住人，下面堆放雜物，養豬養狗，通風好，防潮，蚊蟲飛上去的也少，是南方先民的理想居址。這也是“吊腳樓”的祖先。
今天之所以找不到有巢氏的遺迹，是因爲木制房屋很難保存。但是其後人留下了淩家灘遺址（年）。
族人們非常感激這位發明巢居的人，便推選他爲族長（二元制的ceo），尊稱他爲有巢氏，當時的人是沒有名字的，隻有有重大貢獻的人才會有公認的号，而這個号往往也與其貢獻的内容有關，而有巢氏也成爲其它部落識别該部落的名字。有巢氏被推選爲部落酋長後，爲大家辦了許多好事，名聲很快傳遍中華大地。
在北方由于南方的種種不便，不得不遷徙到黃河流域的人類各氏族，聽說了有巢氏解決了南方的定居難題，紛紛從寒冷的北方遷居到有巢氏居住的巢湖流域。希望學到有巢氏的技術。有巢氏也不辭辛勞地指導各氏族建造樹上巢屋。
各部落的人們都認爲他德高望重，有聖王的才能，一緻推選他爲總首領，尊稱他爲“巢皇”，也就是部落聯盟的大酋長。立都石樓山。漢代緯書《遁甲開山圖》說：“石樓山在琅玡，昔有巢氏治此山南”，即安徽滁州琅琊山（琅耶山）。
年，華夏大地的人們抛棄了黃河流域的統治，改爲遵奉長江流域（巢湖流域）有巢氏的指導。政治中心首次轉移到了長江流域。
有巢氏“王天下”時期，關注民生，胸懷民衆，爲民造福，功高德隆。
原始人群時期人們必須在河流旁邊定居，因爲取水方便。有巢氏發明了鑿井飲水的方法，大大拓展了華夏人類的生存空間。
有巢氏發明了編織技術，進而發明了木匠技術，以及建築技術，用來造屋（編織加泥彌縫）技術。用編織技術将幹草編織成被褥。古人得以安居一處，家園的夢想終成現實。最早的巢居又稱爲“樹上居”，顧名思義，是建在樹上的，後來才延伸到了平地上。巢字本身爲木上架格子上有三個人，形象地說明了樹上巢居的生活。
有巢氏時期繼續推行盤古氏的族外婚，實行族外群婚及走婚制。排除了兄弟姐妹間的通婚關系，同一氏族内部的同輩男女也禁止通婚了。男子隻能選擇其它氏族的女子爲“妻”，女子隻能選擇其它氏族的男子爲“夫”。就是說甲氏族的一群男子（或女子）可以和乙氏族的一群女子（或男子）互爲夫妻，這便是母系氏族社會的族外群婚。族外群婚隻準許甲（乙）氏族的一群男子夜裏到乙（甲）氏族和那裏的一群女子過性生活，第二天早晨這些男子就得回到本氏族去，不準許留在女子所在的氏族。而女人一生都不準許離開本氏族。這種族外群婚相對于血緣群婚，顯然已經有了很大的進步。有巢氏的功德，反映了中國原始時代由穴居進入巢居的文明進程。
有巢氏實際上代表着當時人類發展的一個階段，從原始的山洞居住發展到建造房屋的階段，是進步的一個标志。巢湖流域被公認爲是古人類最早的發源地之一。有巢氏開拓原始時代由穴居進入巢居的文明時代。
《木處巅，風生燥，颠傷、燥夭。于是有聖人焉，教之編槿，而盧緝藋，而扉塓塗翳，以違其高卑之患；而違風雨以其革有巢之化。故，亦号有巢氏。駕六龍，從日月，是曰古皇。龜龍效，圖書畀，于是文成而天下治。
其爲政也，授而弗惡，予而弗取，故天下之民皈仁焉。其及末也，有禮臣而貴，仕之專而不享。欲削之權，懼而生變，有巢氏遂亡。居于瓕及盤領。》
《逸周書·史記解》：“昔者有巢氏，有亂臣而貴任之，以國假之，以權擅國而主斷，君已而奪之。臣怒而生變，有巢以亡。”
最後一位聯盟首領時期，這時族長特别信任一位大臣，當時是沒有名字的，所以也沒有留下名字。這位大臣被授予了處理國政的權力（即總理大臣），于是這位大臣廣豎黨羽，不禀報族長就自己決定部落聯盟的大政方針，擅自向各部落發布命令。
族長察覺到了這位大臣的不妥之處，于是公開宣布廢除他的權力。這引起了這位大臣的強烈不滿。這位大臣帶領自己的親信部下和親屬發動了兵變，将族長殺死。
這位大臣認爲自己也是族長的親屬，所以也有權力繼承族長乃至部落聯盟的首領地位。但是由于他的兵變行爲很倉促，沒有得到各部落的支持。所以各部落都拒絕承認他的地位，進而拒絕承認有巢氏部落的聯盟中心地位。于是有巢氏部落雖存，但是不能再“王天下”了。