不過荀貞目前用兵的重點還是在陸地，水師這一塊兒不急，可以慢慢來，先從培養魯肅等人起步即可。
比起真正的“白手起家”，於籌建水師上，荀貞其實已經是少了許多困難的阻撓了，至少他手底下現在有魯肅、劉晔這樣的一等謀士，有甘甯、蔣欽等這樣稍加鍛煉就能用的水師将校。
繼興修水利、榷鹽、辦州學、整編泰山兵等内政以及聯姻揚士、兵進兖州等外事之後，荀衍鹽鐵開府、袁綏掌籌舟師，此兩事乃成爲了徐州二府接下來需要重點去做的頭等要務。
蒲滬現爲幕府的将作祭酒，管着将作、工、都水三曹，與管着田曹等五曹的陳群、士曹等九曹的宣康和兵曹等十曹的袁綏一樣，是幕府裏的“實權人物”，所以，他也在今日的會上，荀貞把他叫出來，對他當面交代了幾句，令他好生輔助袁綏，務要把舟師籌建事做好。
蒲滬應諾。
荀貞的幕府現共有二十餘曹，按照不同的職能，荀貞大緻将之分成了四個部分。
主征兵的兵曹、主納糧征輸的集曹等與民事相關的幾個曹，荀貞将之撥給袁綏主管，并及主選署功勞的功曹、主掌戎律的校軍曹，也在名義上歸袁綏主領，又有負責接待外客的客曹也是由袁綏負責。
主管步卒員額與名錄的士曹、主管騎兵員額與名錄的騎士曹、主管軍醫的醫曹、主管軍械的戎曹等與兵士密切相關的幾個曹，荀貞将之撥給宣康管理，包括荀貞設了一個教授兵士文字、基層軍官兵法的文學曹，也由宣康主掌。幕府的這些曹之外，郡縣的武庫也歸宣康掌轄。
主屯田畜養的田曹、倉儲的倉曹、錢糧的金曹、支出的度支曹等與軍資錢糧直接相關的幾個曹，荀貞則将之撥給了陳群，由他總責。
第四個部分即是蒲滬所負責的将作等三曹。将作曹主營壘兵帳、工曹主軍械器物、都水曹主屯田水利，此三曹俱是與興造、冶鑄有關。
這四個部分是幕府的主要構成，另又有主司法的理曹、主兵士爲盜賊者的賊曹，這兩個曹實質上是歸校軍曹管領；又有主記曹、議曹、少府曹和帳下督，這四個曹直接對荀貞負責，事實上，由袁綏名義上領之的功曹、校軍二曹也是直接對荀貞負責的。
功曹、校軍曹一掌“功”、一掌“罰”，權力很大，功曹遂被軍中呼爲“大曹”，功曹掌的是升遷，得不到升遷沒關系，最少可以保留原職，校軍掌的是軍法，觸了軍法可就是降職、以至殺頭的事兒，因而軍中尤忌憚校軍，呼爲“太曹”，謂其權力比大曹還要大。
荀貞重視魯肅，所以魯肅早前初到州府，他即擢任魯肅爲幕府功曹掾，隻是功曹、校軍曹權力雖大，然如“州刺史”，權重而位卑，名分、品秩卻都不高，是以魯肅沒有資格參與類似這樣三日或五日“一會”的正堂議事，劉晔現爲幕府的議曹掾，亦沒有資格與會，因此，待議事散了，荀貞特地把他兩人召來，當面給他兩人講述了一下籌建舟師的決定，并告訴他兩人，此次籌建舟師雖以袁綏爲主，然袁綏日常事務繁雜，具體的工作當由蒲滬及他兩人負責。
荀貞說道：“戰船之建造，可由蒲觀水主掌；兵卒之料選，部曲之組建，可由卿二人總管。淮泗多壯士，卿二人生長淮泗間，熟知縣鄉人物，可多爲我募些戰士。”
魯肅、劉晔俱皆明士，一聽即知，荀貞這是在給他倆“飛黃騰達”的機會。
可以設想：等舟師在他們的手中建成後，他們作爲舟師的“組建者”之二，功勞必高，無論是留在舟師内部，還是外調出職，都會獲得顯任。
兩人俱肅容說道：“明公放心，我二人必盡心盡力，不辱君命。”
荀貞笑道：“卿二人之才，我知之也。盡管放手去做，如有什麽困難，盡管找我言之。”
魯肅問道：“敢問明公，戰士限以多少爲數？”
“先期籌建，人數不宜過多，三千之數罷。”
“諾。”
“吾軍中多北人，将校通水性者寡矣，卿二人募戰士之餘，可多留意知水戰的豪傑，倘有所得，即舉薦與我。”
魯肅、劉晔應諾。
“爲方便卿二人募召戰士、豪傑，給卿二人各加授督舟都尉銜，待幕府把印绶制好，卿二人便可領之，開始行事了。”
魯肅、劉晔應諾。
魯肅、劉晔、甘甯、蔣欽等現各有職務，荀貞既然決定調他們籌建舟師，那麽或者給他們加授職銜，或者進行必要的人事調動就是必要的了，給魯肅、劉晔加授過職銜，荀貞令幕府給甘甯下檄，改授督舟都尉，調他來州府，又給現職假校尉的高甲下檄，調他繼任彭城都尉。
甘甯在彭城有千餘部曲，按照荀貞的指示，幕府在給甘甯的檄中寫得清楚明白：叫他隻挑出一曲通水性的兵士來州，餘下的皆留在彭城駐地，由高甲到任後接管。
荀貞對原本曆史中三國時期的政治、軍事等各方面雖然不是很了解，但也知道孫吳政權於軍事上有一大特色，那便是世襲領兵制，這是因爲在孫吳創業之初，不少的将校多有家兵，所以某個将領死後，通常會由他的子侄繼領他的部曲，這一制度有利有弊，但就荀貞而言之，他是絕不會讓這種情況出現在他的部隊中的，因而，不但是對甘甯的這次調動，包括在此前的防區轉換等調動中，除非必要，他大多也是隻調将校，不調其部。
對甘甯如此，對高甲也是如此，亦是令他最多隻帶一曲兵士上任。
五月快中旬時，許仲、陳褒、江鹄、劉備等在徐卓的協調、配合下完成了任城縣駐軍的調換、東平國江鹄部的入駐以及合鄉駐軍的防線建成，許仲、戲志才等歸州中。
入了徐州，在合鄉，許仲先令部曲回下邳，然後隻帶了數曲兵士，與戲志才、張飛等同來到州府，給荀貞彙報這一次軍事行動的整個經過，并交還虎符。荀貞留他和張飛在州府住了幾天。随後，許仲帶着張飛回下邳，仍負責下邳防區的軍務。
周泰、蔣欽於此戰中稍立功勞，荀貞授蔣欽督舟司馬職。
蒲滬、魯肅、劉晔此時已開始了舟師的籌建，甘甯也從彭城到了州府，亦參與到了其中，荀貞令蔣欽從魯肅、甘甯等也參與了進去。
周泰雖是新投不久，可他在從許仲出戰前，與蔣欽俱被荀貞留在幕府，得以與荀貞常見，荀貞頗是喜歡他的性格，又因一時沒有合适的外放職位，即就擢周泰爲幕府的門下督，位與左伯侯、原中卿并列，仍舊把他留在了幕府裏邊，常從左右。
許仲、戲志才從兖州帶回來了有關兖州近況的消息。
自知劉岱要親擊兖北黃巾後，荀貞對兖州密切關注。
徐卓上的兩策都不能用，荀貞這些時日也一直在想，有沒有更好的辦法可以使自己能在劉岱的這次親擊兖北黃巾中得利？再三考慮，竟是無所得。是以，待許仲、戲志才到州府後，荀貞又和他倆就此事商議了好幾次，但最終也隻得出了一個結論：唯坐觀可也。
許仲、戲志才等從任城回來之時，兖州各郡願意聽調派出的兵馬數目大體都已報給了劉岱，
曹操親率四千步騎，人數最衆，鮑信部三千人，泰山應劭、濟陰吳資亦遣三千，山陽、陳留都是兩千，東平、任城轄地小，又一個與荀貞接通款曲，一個境内現有荀軍駐紮，故而各隻遣出了數百兵卒，劉岱調出了州兵七千，州郡兵加在一起，計有兩萬五千餘步騎，李乾受州府召用，出了三百餘部曲，别的郡縣大姓也有受召的，他們遣出的總共有兩千餘家兵。
兩萬五千餘州郡兵，三千餘的豪強部曲，将近三萬步騎。
這些步騎現有已至昌邑，聚在了劉岱帥旗下的，也有沒去昌邑的，如鮑信、曹操、東平李瓒部、泰山應劭部因爲或就在濟北、或離濟北近，所以沒有到昌邑與劉岱會師，而是屯守郡内、抑或移兵至濟北界外，等劉岱率軍到達。
比之号稱百萬的兖北黃巾，這點人馬看似不多，但要知，荀貞目前也不過才有三萬餘步騎而已，分兵駐守各郡，已然震懾得青州、兖州黃巾不敢入犯，若是兖州的這近三萬步騎皆是訓練有素的老卒、戰力可與荀軍相較的話，把那“百萬兖北黃巾”擊破倒也不是不可能。
退一步講，即便這近三萬的兖州兵不能與跟從荀貞轉戰數州的積年勁卒相較，可有曹操、鮑信在軍中，隻要他們肯積極地爲劉岱出謀劃策，又隻要劉岱肯聽從他們的意見，兖北黃巾雖衆，卻亦不足畏懼，縱然因爲兵力劣勢而進不能破，然退也足可自守，仍是有獲勝之機的。