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率部攻占吉安府轄各縣的正是太平軍第三鎮鎮将蔣和。自北伐以來，蔣和多有聯絡各軍将領，言要效仿陳橋驿，爲大帥披黃袍，爾後各軍回師廣州，将那鳥唐王廢爲庶人，從此兩廣姓了周，大夥俱都做從龍功臣，然後再揮師北伐，滅了滿州鞑子，将來大夥封妻蔭子，公侯百代。
不想北伐以來，第三鎮便一直爲先驅，作前鋒，與各軍之間往來無多。拿下贛州以後，周士相帶第一鎮、第十五鎮和新二鎮圍攻吉安府城，蔣和則被命令率所部第三鎮掃蕩吉安府轄各縣，使得蔣和遲遲無法落實爲大帥“披黃袍”的念頭，一肚子憋屈自是全撒在了那些冥頑不靈，不肯歸降的清朝官吏頭上。
第三鎮先破永豐縣，殺城中清朝官員9人，士紳28人。被殺之人還包括這些人的家眷，當日隻殺得永豐人頭滾滾，不少士紳大戶就此滅族。蔣和又命将永豐被殺之人首級全部拿鐵絲串上，派人送到安福縣，吓得安福知縣當即開門歸降。此後又有龍泉、泰和、廬陵三縣或受複明大義所感，或爲局勢所迫，攜全城紳民反正。
永新知縣周泰昌爲順治十年同進士出身，自感受清恩甚重，拒絕歸降明軍。結果城破，周泰昌一家19口無一得存，本城千總陳孝忠連同縣學諸生50餘人伏誅，使得永新縣自此生員斷絕，時人哀呼文脈底斷。利用永新歸降營兵詐開了永甯城後，蔣和又故計重施，命将知縣管某、士紳20多人連同其家眷，不論老弱，盡皆從南城摔下。又派兵捕捉當日城上協守青壯600餘于東門三裏亭坑殺，緻使永甯城中家家有喪。鄰近萬安縣士紳聞永甯慘事，士紳聯同衙門書辦小史一起行事，将不肯開城歸降的清知縣捆送太平軍前，從而保全該縣。
贛州以北，新二鎮進展順利，先後奪取興國、甯都、安遠、瑞金、龍南、石城、長甯、會昌等縣，又有信豐、雩都、安遠、廣昌、南豐等縣舉城反正。新二鎮前鋒甲旅兵進建昌府，建昌府清軍不敢抵擋，往北面撫州方向逃竄。
太平軍中軍主力第一鎮、第十五鎮、新一鎮及騎兵一部在大帥周士相親自指揮下包圍了吉安府城。因吉安一帶暴雨如注，緻使太平軍行動困難，營盤安置也十分不便，原先定于以火藥爆破吉安府城也因地濕不得行，故周士相隻令各軍将吉安團團圍住，重挖深壕，重築營城，每日以火炮攻城，不克不休。
吉安城中清軍人心惶惶，糧食價格陡漲，生火木柴也短缺。清江西提督劉光弼派人向南昌告急，稱内絕糧草，外無救兵，勢難久待。清江西巡撫張朝璘此刻卻是一點援兵也調不出，反而要爲南昌城的安危焦心竭慮。原來贛州被太平軍攻占的消息傳到江西各地後，便引發了一連串的反清起事。
原崇祯朝兵部主事江星桂、生員馬江等人在南康府起兵響應。馬江自稱巡撫，江星桂稱兵部尚書，攜衆數千先後攻克都昌、湖口、星子等縣。清南康副将徐學易等人見勢危，兵力不敵，下令全軍入南康城憑險扼守。豈料南康都司陳萬和等人卻被江星桂等人的使者策反，領兵數百在安義縣舉旗反正，使得南康城頓時成了一座孤城。
鄱陽湖一帶向來就有水匪聚集，清軍數十次進剿都未能徹底平定，這會各水匪也是趁着清軍手腳大亂，兵馬空虛的機會相繼而起，各立山寨，以永曆紀年造作符印，以次拜官，自郡縣、監司、撫按、科道、部院、總鎮之屬鹹備。其歌曰“弟兄一千七，天下無人敵。有人來犯我，一個一兩一”。有其他水匪和綠林沒有起兵反清的，這些鄱陽湖水寨便會聯合攻打，迫使對方一起舉旗。總有十八寨，寨主稱複明天下兵馬大元帥，其下總督數人，巡撫數人，五軍都督一應俱全。
太平軍新二鎮尚離建昌府泸溪縣百餘裏地時，本城清朝知縣和縣丞等人便俱攜印潛逃，城中百姓紛紛出城避難，諾大一座縣城，等到太平軍前鋒探馬來時，竟是空無一人，直叫那些太平軍探馬以爲這城是座鬼城。自甲申以來，此事還爲頭一樁。
各地一些士紳學子也趁勢起兵，百姓平日多受清廷榨取，這時便也紛紛響應。雖烏合之衆，卻因各地清軍空虛，幾乎建制官兵，故瞬間便能成事。撫州樂安知縣胡某平日貪贓枉法，加田畝過額，結果城中一小兒突發大喊“大明兵至”，百姓瞬間揮臂呼吼向縣衙沖去。衙役捕快無人敢阻，胡某吓得藏于茅房之中，結果被憤怒百姓搜出，将其活活溺死在茅坑之中。
南昌府豐城縣也發生了紳民數百掠市，官兵驚散之事。巡撫張朝璘派副将吳之培領兵百人前往鎮壓，結果兵行半路便自相潰散。武甯縣紳民鄉宦公然網巾大袖，口稱大事已就，勸知縣速爲迎順，以至人心洶洶，各地官員無一有固守之志。
瑞州上高縣匠人馮國材化名朱弘圖，假稱史閣部名義，領學徒親友十多人起兵，竟是一下就奪了上高縣城。其後，馮國材派人聯絡高安、新昌和瑞州府城的士紳鄉宦，準備一起舉旗攻占府城。瑞州清軍千餘人來剿，馮國材率鄉民奮勇抵抗，原先約定起兵諸鄉紳竟無一人至。苦戰兩個多時辰，馮國材被清軍擒殺。
清江西監察禦史李之粹竟然派人偷偷送信給周士相，信中說：“人心未死，誰無漢思？公創舉非常，爲天下倡，天下鹹引領企足，日夜望公至！”
除去已被太平軍攻占的府縣，江西其餘諸府無一府無有士紳鄉民舉旗反清，張朝璘見人心不穩，爲了防止内變，竟然把在江西降清的原李成棟部将陳胤、丁全桂等人全部殺掉，又命在城中大肆逮捕有複明嫌疑的士紳讀書人，更強行拉夫征丁，全城百姓敢怒不敢言。