在晉封大西軍一幹将領之外，永曆帝還重用原本就是明臣的黔國公沐天波，除了讓其有緊急事件可以随時入奏外，還讓他執掌護衛宮廷的禁軍。
與此同時，李定國在昆明的五華山爲永曆帝修建皇宮，從安龍一并到昆明的大學士扶綱、雷躍龍、吏部尚書張佐宸、吏部文選司郎中汪蛟等人組建了昆明朝廷的六部九卿。同時内閣也成立，讓人吃驚的是，新入閣的大學士竟然還有從前和孫可望有過勾結的權臣馬吉翔。
馬吉翔是武進士出身，早年随明磊平定靖江王之亂，曆官至廣東都指揮使。甲申年李自成攻入北京，馬吉翔人在廣東。弘光元年，因事罷官，後來永曆朝廷在肇慶建立，他被啓用爲兵部尚書，負責鎮守肇慶。永曆帝西逃廣西時，馬吉翔領着人一路保護，故而深得永曆信任。但自從永曆帝到了安龍府被孫可望軟禁起來後，馬吉翔便抛棄舊主和孫可望勾結在一起，同他一起投靠孫可望的還有司禮太監龐天壽。
在去昆明的路上，龐天壽唯恐李定國會找自己算帳，并且一路上永曆對他也是言語冷漠，龐天壽害怕到了昆明後自己會被拖出去砍頭，便咬牙服毒自殺。其侄龐天賜則趁人不備逃脫。
龐天壽死後，李定國讓手下大将靳統武将馬吉翔看管起來，結果馬吉翔實在是精明，竟然乞憐獻媚于靳統武，又不斷在勒的面前說李定國的好話，痛罵孫可望，再加上永曆帝對馬吉翔也念舊情，于是李定國便放過了他。
昆明内閣組建後，永曆帝欽點馬吉翔入閣辦事，李定國對此并未反對，結果馬吉翔的入閣引得那些正直的永曆朝臣罵聲一片。
不過不論如何，移跸到昆明後，永曆朝廷總算是有了些氣象，除了皇帝不再受制于人，忠于永曆的文臣們也終于可以把朝廷運作起來。
從前永曆朝廷大小事務都是由遠在貴陽的孫可望所設六部九閣辦理，安龍府隻是個空架子，現在朝廷終于能夠不再受制于人，一幹文臣們揚眉吐氣，甚至有大臣上書當以晉王、蜀王精兵讨伐孫可望這個“不臣”的僞國主。
這份上書沒有得到永曆帝的任何回應，也沒有得到李定國的回應。在如何對待孫可望這個秦王國主，李定國和永曆帝的态度是一樣的，都不想和孫可望兵戎相見。因此永曆帝派白文選和張虎爲使者攜帶玺書前往貴陽，希望勸說孫可望消除隔閡，重歸于好。
臨行前，永曆帝召見白文選和張虎，各賜他二人金篦一枚，并叮囑道：“二位卿家此去貴陽，務必将朕之和好之意轉告于秦王，希望秦王能以祖宗社稷起見，能以天下蒼生百姓爲念，不使同室操戈。若朕與秦王能言歸于好，朕必不負二位卿家，他日恢複江山，二卿家子孫可世代與大明休戚與共！”
白文選本就敬重永帝曆，當下忙道：“皇上放心，臣到貴陽後肯定勸說秦王來昆明觐見皇上。”
一邊的張虎卻暗哼一聲，道：“臣去貴陽但将陛下所說轉于秦王知曉，秦王是不是能如陛下所願，則非臣能所左右的。”
聞言，永曆帝微微點頭，擡手示意内監送二人出去。待白、張二人走後，永曆方對屏風後走出的王皇後說道：“白文選忠厚，那張虎卻是個反骨之人，隻怕他去貴陽後會壞事。”
王皇後有些不解，疑惑道：“陛下既知張虎不可信，爲何還讓他去？難道不能派别的大臣去嗎？”
“不成的。”
永曆搖了搖頭，苦笑一聲，對王皇後解釋道：“張虎是孫可望的親信之人，我封他爲淳化伯便是做給孫可望看的，以顯朕對他過去之事并無計較之意，反而更加信重于他的意思。”稍頓，又道：“這次派人去貴陽，晉王認爲旁人都不足讓孫可望信服，唯這張虎去，孫可望才會相信朕并無惱他，更無恨他之意。”
王皇後深感晉王李定國救駕大恩，更信他爲人，知他忠義，因此一聽張虎是李定國選的人，當下就點頭道：“臣妾以爲孫可望若真能以臣節侍皇上，便不會計較去的人是誰，若他仍舊野心勃勃，那派誰去都是一樣的。這張虎既是晉王提的人選，那想必晉王自有打算，皇上也不必多慮...晉王能征善戰，麾下又有虎贲将士數萬，清軍尚不敵也，況孫可望乎？他真敢率兵前來，怕也隻能自尋其辱，公理大義畢竟是在皇上這邊的。”
“有晉王在，才有朕的今天啊，朕也相信他定會扶保朕恢複祖宗江山。不過若孫可望真的要與朕興兵，朕也隻能與他一戰到底了，屆時一切就看晉王的了。”
永曆感慨一聲，上前握着王皇後的手，想到王皇後這些年跟随自己受過的苦難，再看她日益消瘦的身子，不禁鼻子一酸，柔聲道：“這些年朕對不住皇後，讓你吃了不少苦，朕...朕愧爲天子，也愧爲丈夫啊...”言畢，竟是紅了眼睛。
王皇後亦是眼含淚水，輕聲道：“皇上怎的說起這些了，臣妾不覺得苦，隻要能與陛下在一起，臣妾就是受天大的苦也覺幸福。”
“以後會好起來的，會好起來的，朕發誓再也不讓你随朕過那朝不保夕的日子了！”
永曆帝深情抱住王皇後，夫妻二人就這麽緊緊抱在一起，這瞬間，時間都好像停滞了一般，夫妻二人隻覺世上再無他物，隻他二人于此間靜靜而立。
殿中伺候的一幹内監和宮女哪個敢不識趣，都悄悄秉氣呼吸，大氣也不敢喘一聲，唯恐驚動了帝後。