戰役結束之後，朱祁钰進行了防禦性的部署。當時，大部分将領都主張繼續進攻，甚至連楊天奉都認爲應該乘勝追擊，利用奧斯曼帝國陣腳大亂，後方防禦部署完全沒有到位的機會，派遣騎兵向伊斯蘭堡發動進攻，一舉消滅奧斯曼帝國。不過，朱祁钰卻根本就沒有理會這些将領的意見，直接下令，讓部隊在新的戰線上轉入了防禦狀态。當然，朱祁钰這麽安排，有很多理由。
讓朱祁钰放棄繼續進攻的主要原因有三個，一是戰役目的已經達到，而要實現戰略目的，進攻不是最好的選擇。二是軍隊需要休整，幾支主力部隊都連續作戰數日，已經達到了官兵體力極限，必須停下來休整，而且補充彈藥物資需要時間。三是，完成新占領區的控制，調遣其他國家的軍隊也需要時間。正是這三個原因，讓朱祁钰決定暫時轉攻爲守，當然，還有另外一個原因，朱祁钰沒有說出來，不過他會用行動告訴手下的将領。
這次戰役的三個目的，分别是：大量殲滅奧斯曼軍隊的有生力量；扭轉戰場局面，迫使奧斯曼軍隊轉爲戰略防禦；将戰線推進一百到兩百裏，将東部與南部戰區銜接起來。從戰役的結果來看，這三個目的都達到了。顯然，戰役已經獲得了勝利，也取得了成功。而戰役是爲戰略服務的，而在針對奧斯曼帝國的戰争中，戰略目的自然是要徹底消滅奧斯曼帝國，而要做到這一點，殲敵有生力量是關鍵中的關鍵，隻要消滅了奧斯曼帝國的主力軍隊，那麽就消滅了奧斯曼帝國，如果沒有消滅奧斯曼帝國的主力軍隊，就算攻占了奧斯曼帝國的首都，那也算不上是完全的勝利，奧斯曼帝國的勢力仍然可以在其他的地方死灰複燃。爲了達到這個戰略目的，那麽通過有效地戰役部署。并且利用每一次戰役來消滅敵人的有生力量，這就是最爲重要的了。
從當時的情況來看，如果明軍繼續進攻的話，以衆多騎兵軍的快速突擊能力，以及騎兵部隊在得到了炮兵支持後的強大陣地戰實力，要攻打伊斯蘭堡，甚至是打下伊斯蘭堡，确實不成問題，也許就隻需要幾個月的時間。朱祁钰就可以到伊斯蘭堡去慶祝勝利了。但是這個勝利是不完全的。奧斯曼帝國在歐羅巴那邊還有着廣袤的土地，而明軍在攻占了伊斯蘭堡之後，還需要花費不少的時間來控制住奧斯曼帝國在亞洲地區的領土。因此不可能在短期内進軍歐羅巴，這就給了奧斯曼帝國喘息的時間，導緻的結果就是戰争時間延長。顯然，與其讓奧斯曼帝國被迫退到歐羅巴去休養，還不如引誘奧斯曼帝國将更多的兵力投入到亞洲戰場上來，耗幹奧斯曼帝國的所有力量，以此來獲得徹底的勝利。
對于明軍自己來說，在經過了這場大規模戰役之後。六個參戰軍的官兵已經非常疲憊了，特别是近衛軍，第一軍，第二軍以及第九軍，幾乎都連續作戰好幾日，官兵幾乎沒有得到休息的時間。而這四支部隊都是主力，其中三支是騎兵部隊，如果讓他們繼續進攻的話，顯然，這隻能拖垮他們。除了官兵的體力之外，作戰物資的補充也需要時間。當時第一軍就已經出現了物資短缺的情況。而且第二軍與第九軍在攻占了摩蘇爾之後，也沒有立即得到所需要的全部物資。而等待下一批物資運抵白羊王國，這更需要時間。
戰線推進的一個結果是壓縮了奧斯曼帝國軍隊的活動空間，而另外一個結果就是。新出現的戰區需要花時間來穩定。當時，負責前線地區。也就是戰線後方地區的控制任務的是白羊王國的軍隊，以及聯合軍團，而主力就是白羊王國的軍隊。而這次明軍一次性地将戰線推進了一百五十裏到兩百五十裏，白羊王國的軍隊需要充足的時間來穩定新占領區的局勢，控制住這一地區地居民。當然，在明軍承擔了主要的進攻任務之後，白羊王國地軍隊基本上已經從一線戰場上抽調了下來，不再需要他們去守衛防線了。
這三個原因是朱祁钰用來說服手下将領的，當然，就算他不給出理由來，隻下一道命令，那些将軍們也自然不敢多言了。當然，轉入防禦狀态隻是暫時的，而且朱祁钰也保證，将在軍隊恢複了精力，作戰物資得到了補充，以及新占領區的局勢穩定下來之後，立即發動下一輪進攻行動。不過，在此之前，防禦任務還是要安排下去的。
當時，負責戰線防禦的主要是第三軍與第一軍。其中，第三軍負責守衛東部防線，第一軍則負責守衛以安條克爲核心的南部防線。除此之外，朱祁钰還将第八軍調到了前線來，将第八軍部署在了摩蘇爾，負責第一軍與第三軍防線的結合部的防禦工作。摩蘇爾的安全直接決定着明軍整條防線的安全，讓第八軍來負責這裏的防禦工作，自然是最爲穩妥的了。當然，第八軍在後方的工作也全都移交給了聯合軍團。
除此之外，第五軍撤回去繼續休整，這次是迫不得已才讓第五軍參戰的，本來第五軍的休整工作就沒有完成，而楊天奉又一直鬧着要進攻，結果，朱祁钰就很幹脆的把朱祁钰派到了白羊王國南部去接受全面休整。第二十二軍回到了大不裏士，與第九軍一起擔負起了爲第三軍提供支援的任務。第二軍進駐大馬士革，爲第一軍與第八軍的預備隊。
隻有之前沒來得及參戰的第二十一軍分到了一份美差，那就是以摩蘇爾爲根據地，對奧斯曼帝國的腹地進行襲擾，拖住奧斯曼軍隊重新部署防線的速度，爲下一次進攻打下基礎。
對于皇帝的這番安排，大部分的軍長都感到滿意，可能意見最大的就是楊天奉了。在楊天奉看來，第五軍已經得到了幾個月的休整時間，這已經足夠了，沒有必要再進行休整。結果，皇帝卻把第五軍給調到了大後方去，直接就把第五軍給安排在了離戰場最遠的地方。顯然，楊天奉心裏是很不滿的。他可做夢都在想到第一個進入伊斯蘭堡呢。不過，楊天奉不滿歸不滿，還是得乖乖的帶着第五軍南下了，這是他沒有辦法抗拒的事情。
當然朱祁钰也對戰區的指揮權限做了安排。衛平負責東部戰區，謝正卿負責南部戰區，胡沱負責兩個戰區之間的協調，而陳豫則負責總協調工作。另外，張國煮，馬壽成，李天長三人也都有各自的位置，隻有楊天奉一個人被皇帝涼快到了一邊去，大概是朱祁钰要他好好反思一下吧。或者說，是讓楊天奉不要光想到作戰的時候，去專心安排第五軍休整的事情。
做完了這番安排與部署工作之後，朱祁钰宣布了另外一件事情：他将前往顧成林的大西洋艦隊，并且在下次戰役開始之前返回遠征軍。這下，所有人都蒙了，皇帝可是遠征軍的總司令，皇帝一走，那遠征軍怎麽辦？當然，朱祁钰并沒有任何擔心的，他已經爲各支部隊做好了安排，而且奧斯曼帝國在幾個月時間之内根本就不可能對明軍構成威脅。另外，他将近衛軍留在了貝魯特港，命令梁嶽暫時代替他管理各部隊之間的事務。
本來，朱祁钰去大西洋艦隊也沒什麽，畢竟各軍的軍長對自己的任務都很明白，而且在這些軍長中，已經有了一種得到默認的等級關系。其中衛平的資曆最老，陳豫次之，然後是張國煮，楊天奉，胡沱，謝正卿，馬壽成，李天長，雖然，這八個軍長之間的軍銜高低并不如此。
不過當時仍然是以資曆爲主的。也就是說，如果有突發事件的話，那麽就是按照這個順序來決定指揮權限的。當然，這隻是一套默認了的等級關系，不過這卻是比較有效的。不過，問題也就出在了這裏。雖然，在幾個軍長中，梁嶽的資曆與陳豫是同等的，不過，對于大部分的将軍來說，其實梁嶽就是個近衛軍軍長而已，與其他的将領有很大的區别。
如果朱祁钰不安排梁嶽來暫時替代他的位置的話，這個問題就不存在，不過，朱祁钰卻讓梁嶽來暫時執行總司令的職務，這下問題就有點嚴重了。不過，并沒有人反對皇帝的安排，畢竟皇帝這麽安排是有理由的，不管這個理由在其他人看來是否成立，這怎麽都是皇帝的安排吧，而且對朱祁钰率領的這批将軍來說，皇帝有政策，下面地将軍就有對策。
當時，幾個人的對策很簡單，那就是說服梁嶽，讓梁嶽最好少幹預各軍的事務。而被選出來的說客就是陳豫。陳豫與梁嶽的關系是非常密切的，在朱祁钰還不是帝國皇帝，而隻是個王爺的時候，陳豫與梁嶽就已經并肩作戰了。兩人是陳懋手下的主要将領，在戰場上共同經曆了生與死的考驗。而在朱祁钰登基之後，兩人也都得到了重用，雖然後來基本上都天各一方，很少有合作的機會，不過兩人之間的感情仍然非常好。讓陳豫去做說客，這自然是最好的選擇了。
當然，朱祁钰并不知道手下将領在他背後搞的這些鬼。在他安排各軍的部署與任務的時候，就派人去聯系上了顧成林，随後，他就帶着近衛軍去了貝魯特港，将近衛軍留在了貝魯特堡之後，朱祁钰就帶着那些從來不會離開他半步的侍衛登上了“皇帝”好旗艦。當然，顧成林是到港口裏來迎接他的。此時，大西洋艦隊雖然已經北上進入了愛琴海，不過顧成林還是特意趕了回來。
陳豫等人也趕到了貝魯特港來給皇帝送行，朱祁钰并不想讓陳豫他們都過來，不過想到這些部下的心情，他也就不好拒絕了。
“衛平，你是衆多軍長中年紀比較大的一個，而且第三軍的任務也是比較沉重的，朕去艦隊的時候，你這邊要盯緊點！”
衛平笑着點了點頭。“陛下放心吧，第三軍還等着陛下率領我們遠征呢！”
“陳豫，你也算是有衆多經曆的了，當年陳懋推薦你的時候，朕就知道你是個值得讓朕相信的将軍。”
“陛下……”陳豫嘴唇微微顫抖了一下，“第二軍不會給陛下丢臉的。”
“張國濤，你是最穩重，也是年紀最大的一名軍長了，這次好好表現，回去後，朕會好好獎賞你的！”
張國濤隻是點了點頭，而沒有多說什麽。
朱祁钰一一向這些軍長做了吩咐，然後長出了口氣，看了一眼停靠在身後碼頭旁邊的“皇帝”号旗艦，最後又看了一眼站在他面前這一排将軍。這都是跟随朱祁钰征戰多年的将領了，其中很多都與朱祁钰一起在戰場上拼殺過，對帝國的貢獻不可以說不大。當然，他們也從來沒有讓皇帝失望過，可以說，帝國能夠戰勝這麽多的強大敵人，這些将軍的功勞是最大的，而且正是在他們的率領下，帝國軍隊才一次又一次的獲得了勝利。
“陛下，時間不早了！”顧成林在皇帝耳邊小聲的說了一句，然後看了一眼對面的那些陸軍将領。
陸軍與海軍将軍在服飾上的差别就很明顯。帝國陸軍将軍的軍服與軍禮服都是統一的暗黑色，給人一種嚴肅的，莊重的感覺。而帝國海軍将軍的軍服與軍禮服是深藍色的，雖然在遠處看上去，深藍色與黑色的差别并不是很大，但是在近距離上，仍然能夠準确的分辨出來。另外，兩個軍種将領的配飾也是不同的，陸軍以莊嚴爲主，而海軍以輕快爲主。不過，究竟哪種軍服更好看一點，這就是仁者見仁，智者見智的事情了。
朱祁钰也沒有再多耽擱時間，在向衆多将軍告别之後，就登上了“皇帝”号戰列艦，随後，這艘龐大的戰艦在幾艘護衛艦的伴随下離開了貝魯特港，駛向了茫茫大海，不遠處，專程趕來的護航艦隊已經在海面上排列好了隊列，等待着皇帝前來檢閱。