“關于海軍改組方案，本來是兩個計劃，一是對将領按照資曆和年限予以晉升軍銜；二是某些将領年歲已高，他們自己也不止一次地提出讓賢，這次就準備讓他們安度晚年并提拔一些年輕人候補。但經過今天的檢閱，特别是方才總統、陸總長和薩次長的意見，我覺得還需要對某些不力将領予以調整，要把年輕英銳提拔到能夠讓他們大顯身手的位置上去……”
改組會議的讨論整整持續了一夜，最終達成了如下方案。
海軍司令部，爲海軍中樞指揮機關。
總司令：薩鎮冰上将（國防次長兼，統管海軍）
海防總監：程壁光中将（副總參謀長兼，協同統管海軍）
海軍顧問：譚學衡 （原清末海軍大臣，賦閑後重新出山，不授軍銜）
常務副司令：湯芗銘中将（留任）
副司令：吳應科少将（長江艦隊署理司令轉任，原副司令藍建樞少将年老退役）
海軍參謀長：黃裳治少将（海軍後勤部主任轉任，原參謀長徐振鵬因不稱職而免）
副參謀長：毛仲芳代将（留任，晉升軍銜一級）
海軍政治部主任：李景曦少将（留任）
副主任：謝葆璋代将（留任，晉升軍銜一級）
海軍裝備部主任：吳紉禮少将（海軍研究所所長轉任，晉升軍銜一級，原主任李和少将年老退役）
副主任：吳德章代将（留任，晉升軍銜一級）
海軍後勤部主任：劉傳绶少将（原海軍一級參事轉任）
副主任：謝剛哲代将（留任，晉升軍銜一級）
海軍學院，直屬海軍政治部。
院長：葉在馥少将（留任，晉升軍銜一級）
常務副院長：高平寒代将（留任。晉升軍銜一級）
副院長：王 桐代将（新任，晉升軍銜一級）
教育總監：曹嘉祥代将（原海軍部高等參謀轉任，謝葆璋不再兼此職）
教育少監：江中清上校（留任，晉升軍銜一級）
技術總監：裴複原上校（原秦皇島副總工程師轉任，晉升軍銜一級）
技術少監：顧燕逸中校（留任，晉升軍銜一級）
訓練總監：葉幼峰上校（留任，晉升軍銜一級）
訓練少監：朱正霖中校（留任，晉升軍銜一級）
海軍研究所。直屬總裝備部。
所長：劉冠南代将（原副所長轉任，晉升軍銜一級）
副所長：黃履川準将（留任）
艦船研究處處長：曾瑞祺代将（留任）
副處長：王伯屏上校（原海軍學院技術總監轉任）
兵器研究處處長：王齊辰代将（留任）
副處長：沈觐宸上校（留任，因主持研制海軍航空兵起降設備有功晉升一級）
工程研究處處長：陳恩焘代将（主要負責岸防、要塞工事，晉升軍銜一級）
副處長：朱 榮上校（留任，晉升軍銜一級）
兵員研究處處長：許世芳上校（負責海軍将士身體健康、主持海軍軍醫學院工作）
副處長：經亨鹹中校（留任，晉升軍銜一級）
海洋研究所處長：吳光宗上校（負責海域、海情、海圖、氣象等）
副處長：林繼蔭中校（留任，晉升軍銜一級）
海軍裝備部四大直屬船廠
江南造船廠廠長：陳兆锵少将（留任，晉升軍銜一級）
總工程師：邝國華代将（留任。晉升軍銜一級）
兵器工程師：陳杜衡上校（留任，晉升軍銜一級）
秦皇島造船廠廠長：鄭清濂少将（留任，晉升軍銜一級）
總工程師：曾宗瀛代将（留任，晉升軍銜一級）
兵器工程師：鄭滋樨上校（留任，晉升軍銜一級）
大沽造船廠廠長：吳毓麟代将（留任。晉升軍銜一級）
總工程師：寇禦麟上校（留任，晉升軍銜一級）
兵器工程師：曹樹棠中校（留任，晉升軍銜一級）
福州造船廠廠長：何品璋代将（原江南廠副廠長轉任，晉升軍銜一級）
總工程師：任 照上校（留任。晉升軍銜一級）
兵器工程師：韓孟傑中校（留任，晉升軍銜一級）
海軍陸戰隊，直屬海軍參謀部，準備在營級規模上擴大爲團級。
團長：暫時空缺
副團長：陳明禮中校（代理團長職務，主持全團工作，晉升軍銜一級）
副團長：周 天中校（秦皇島海軍行營守備營營長轉任，晉升軍銜一級）
參謀長：李曉佟少校（原陸戰隊參謀長轉任，晉升軍銜一級）
一營長：呂冰岩少校（原陸戰隊副營長轉任。晉升軍銜一級）
二營長：馬專若少校（原陸戰隊副營長轉任，晉升軍銜一級）
三營長：常嬰芮少校（原陸戰隊副參謀長轉任，晉升軍銜一級）
炮營營長：華備培少校（原陸戰隊炮連連長轉任，晉升軍銜一級）
海軍各艦艇編成巡洋艦隊、機動艦隊、練習艦隊、巡防艦隊、雷擊艦隊和運輸艦隊共六部分。
巡洋艦隊轄海圻、海容、海籌、海琛、應瑞、肇和六艦，以海圻爲旗艦。
司令：湯芗銘（兼）
第一副司令：吳應科（兼）
常務副司令：葛寶炎代将（練習艦隊司令轉任，晉升軍銜一級）
參謀長：曾兆麟上校（飛鷹艦長轉任，晉升軍銜一級）
副參謀長：張斌元中校（新任）
海圻艦長：葛寶炎代将（兼，原艦長湯廷光去職）
副艦長：吳振南上校（楚觀艦長轉任。晉升軍銜一級。原副艦長鄭祖怡轉任海籌艦長）
海容艦長：林建章上校（副艦長轉任、晉升軍銜一級。原艦長杜錫珪撤職）
副艦長：朱天森中校（江利艦長轉任。晉升軍銜一級）
海籌艦長：鄭祖怡上校（海圻副艦長轉任，晉升軍銜一級，原艦長林頌莊退役）
副艦長：陳世英中校（海琛大副轉任，晉升軍銜一級，即後世有名之陳季良）
海琛艦長：甘聯敖上校（海琛副艦長轉任，晉升軍銜一級，原艦長林永谟去職）
副艦長：鄭碩簡中校（豫康艦長轉任。晉升軍銜一級，原副艦長甘聯敖升任艦長）
應瑞艦長：陳紹寬中校（原代艦長轉任）
副艦長：周光祖少校（原練習艦隊參謀，晉升軍銜一級）
肇和艦長：程耀垣中校（原代艦長轉任）
副艦長：劉華式少校（原練習艦隊參謀，晉升軍銜一級）
機動艦隊轄希望、春、夏、秋、冬、飛鷹、建安、建威、聯鲸九艦，以希望号爲旗艦
司令：沈鴻烈上校
副司令：淩 霄中校
參謀長：楊啓祥少校
希望艦長：沈鴻烈（兼）
副艦長：張楚材中校（福安副艦長轉任，晉升軍銜一級）
航空兵長官：陳英昊中校（新任）
春号艦長：方念祖中校（北巡艦長轉任，晉升軍銜一級）
副艦長：嶽文華少校（新任）
夏号艦長：宋式善中校（北視艦長轉任，晉升軍銜一級）
副艦長：孔重平少校（新任）
秋号艦長：楊宣誠中校（春号副艦長轉任。晉升軍銜一級）
副艦長：武因凱少校（新任）
冬号艦長：劉田甫中校（夏号副艦長轉任，晉升軍銜一級）
副艦長：錢飛揚少校（新任）
飛鷹艦長：趙士淦中校（副艦長轉任，晉升軍銜一級）
副艦長：苗炜藍少校（新任）
建威艦長：佘振興中校（留任，晉升軍銜一級）
副艦長：萬昆和少校（新任）
建安艦長：林國赓中校（留任，晉升軍銜一級）
副艦長：于志民少校（新任）
聯鲸艦長：許鳳藻少校（留任。晉升軍銜一級）
練習艦隊轄通濟、海訓、北訓、飛鴻、龍湍五艦，以通濟爲旗艦。
司令：劉永浩上校（副司令轉任，晉升軍銜一級，原司令葛寶炎轉任海圻艦長）
副司令：鄭禮慶上校（北訓艦長轉任。晉升軍銜一級）
參謀長：孟幕超上校（晉升軍銜一級）
參謀：唐德炘、饒秉鈞、劉贻遠（均晉升爲少校軍銜）
通濟艦長：彭 瀛中校（通濟副艦長轉任，晉升軍銜一級）
副艦長：蕭寶所少校（原練習艦隊參謀轉任，晉升軍銜一級）
北訓艦長：姚葵常中校（副艦長轉任，晉升軍銜一級）
副艦長：李右文少校（原練習艦隊參謀轉任，晉升軍銜一級）
海訓艦長：鄭 綸中校（建威艦長轉任，晉升軍銜一級）
副艦長：陳訓泳少校（新任）
飛鴻艦長：葉芳哲中校（留任，晉升軍銜一級）
副艦長：魏子浩少校（新任）
龍湍艦長：陳石英少校（留任）
巡防艦隊轄北巡、北視、六楚、四江、二永、甘泉、舞風、鲸波共17艘軍艦，以北巡爲旗艦。
司令：饒懷文上校
副司令：何廣成中校（原楚同艦長轉任）
北巡艦長：費開元少校（新任）
北視艦長：劉同濟少校（新任）
楚觀艦長：呂德元少校（留任）
楚謙艦長：王光熊少校（留任）
楚豫艦長：方佑生少校（留任）
楚泰艦長：饒涵昌少校（留任）
楚同艦長：王傳炯少校（舞風艦長轉任）
楚有艦長：李毓麟少校（留任）
江元艦長：郁邦彥少校（留任）
江亨艦長：鄧家骅少校（留任）
江貞艦長：周兆瑞少校（留任）
江利艦長：沈繼芳少校（留任）
永翔艦長：薛啓華少校（留任）
永豐艦長：林霆亮少校（留任）
甘泉艦長：杜逢時少校（留任）
舞風艦長：孫義琨少校（新任）
雷擊艦隊轄同安、豫章、豫康三艘魚雷艇領艦和遼興、遼平、遼遠、遼靜、遼安、遼康、遼威、遼武、湖鵬、湖鷹、湖隼、湖鹗12艘魚雷艇。一般分爲3個小編隊，另有江鲲、江犀兩艘布雷艦。
雷擊艦隊司令：陳 複中校
同安艦長：陳 複中校（兼）
豫章艦長：吳志馨少校
豫康艦長：陳 策少校
各魚雷艇艇長略。
運輸艦隊轄海運、北運、福安三艘運輸艦，以海運爲旗艦。
司令：王時澤上校（留任）
海運艦長：楊征祥中校（北運副艦長轉任，晉升軍銜一級）
副艦長：章世炎少校（新任）
北運艦長：楊征祥中校（原副艦長轉任，晉升軍銜一級）
福安艦長：李國堂中校（留任）
副艦長：方可原少校（新任）
這次方案調整。最引人注目是海軍主力艦、四海艦長的調整，四大艦長原本均爲閩系中堅，在這次改組方案中竟然悉數落馬。而造成他們落馬的原因除了在賬目和公款上不明的情況外。主要原因在于他們對各自軍艦的訓練不夠抓緊。用秦時竹的話說：“海軍不是養懶人的地方。我們用人要貫徹一個原則，即貪者下、庸者讓、能者上。四海艦長雖然在個人品德上并沒有太大地問題。但他們未能正常履行作爲艦長的職責，就是他們最大的問題。也是他們去職的根源。”
在這次調整中，一批原本怪話連天、懶散松懈的官兵都被驅逐出海軍行列。如果說海軍第一次整肅重點抓的是軍人風貌、紀律的話，第二次整肅重點在于狠抓海軍隊伍建設和技戰術訓練，經過第二次整肅，原爲海軍主體的閩系比例繼續下降，各方面也明白了上層鐵腕治軍地決心，海軍的凝聚力和戰鬥力進一步提高。不久後，海軍開展了大練兵、大學習活動。整體面貌煥然一新。
爲了切實體現德奧同盟精神，7月30日中午時分德國武裝力量奉令進入戰争戒備狀态。随後德國政府向俄國政府發出通蝶，要求俄國在12小時内取消總動員。又向法國政府發出照會，詢問法國政府：一旦德、俄開戰，法國是否嚴守中立。限期18小時内回複。截止最後時限，俄、法都無回音，德國政府立即宣布總動員令。當晚，德國政府駐俄國大使向俄國遞送照會。宣布自公元1914年8月1日下午7時起，德俄進入戰争狀态，聽得德國下令總動員後，當日法國政府也下令總動員。至此，歐洲大戰已經箭在弦上。
爲了有效應對，小毛奇代表德國陸軍，提爾皮茨代表德國海軍各自闡述了陸海軍對于戰争的準備，充分表達了對勝利的信心。威廉二世大喜過望，下定決心投入這場世界大戰……