滿桂解開衣甲給皇帝和閣臣們展示過傷口後，崇祯也徹底傻眼了，他有些手足無措地問閣臣：“衆卿家可有什麽見解？”
????滿桂一聽就又在下面嚷嚷起來：“皇上，袁督師這是存心要射死微臣啊，他已經害了毛帥和趙帥了，現在就輪到我了。”
????孫承宗和幾個閣臣此時也已經傻眼了。自大明開國以來，袁崇煥已經幹下了太多驚世駭俗的事情，上次是擅殺欽差大臣、一品節将，這次竟然被總兵官當殿控告謀殺，實在是聞所未聞：“聖上，臣以爲，還是讓薊遼督師來和滿帥對質吧。”
????十一月二十三日，崇祯把袁崇煥招來和滿桂當着内閣地面對質，袁崇煥不能答，多疑的崇祯皇帝終于爆了，讓左右把袁崇煥下诏獄，“朕以東事付袁崇煥，乃胡騎狂逞，崇煥身任督師，不先行偵防，緻深入内地。雖兼程赴援，又箝制将士，坐視yin掠，功罪難掩，暫解聽勘！”
二十四日，祖大壽劫持督師印信寶劍出逃，。
在關甯軍叛亂後，崇祯終于大雷霆，下令徹查袁崇煥在京畿作戰中的指揮。很快薊門一線的指揮部署就被交到了皇帝面前，幾天前袁崇煥縱敵入關後，崇祯還親自爲他辯解，說袁崇煥隻是“不派偵防，竟讓敵潛越。”
調查結果由曹化淳捧給崇祯，袁崇煥和關甯鐵騎又繞大圈，置通州、順義等地的友軍于不顧，一門心思的往京師撤退，放任京畿地區被敵軍鐵蹄蹂躏。崇祯震驚過後就是狂怒：“避敵不戰、縱敵長驅，傳旨，立刻将兩處守将鎖拿進京，窮治其罪。”
????曹化淳愣了一下，小心地建言道：“萬歲爺，他們都有薊遼督師的手令。”
????“這種荒謬的命令也能執行麽？”崇祯已經氣憤得失去理智，他忘記了到底是誰曾給袁崇煥撐腰，以緻會有這樣的後果：“避敵不戰就是避敵不戰，立刻把這兩個人下诏獄。”
????“遵旨。”曹化淳見皇帝氣得厲害，也就不再勸說了，後來這兩者都論罪死、斬立決。
????孫承宗沒有替袁崇煥說話，而是向皇帝建議由他寫一封信給關甯軍。把這些叛軍召回。孫承宗是第一任遼東督師，在關甯軍中一向有威望，崇祯怒氣稍消：“如此，就有勞閣老了。”
????袁崇煥被抓、關甯軍叛亂後，後金軍得到消息，也開始撤離京師，皇太極将那個和尚留在北京城裏，然後帶兵駐跸南海子，繼續搶掠各地。京師解圍後百姓民謠曰“投了袁督師，東人跑一半。”可見袁崇煥所做事情多麽的不得人心。
後金軍在京城郊外擄走頗多百姓錢糧，崇祯皇帝随即命令滿桂追擊，将百姓奪回。滿桂以“敵衆援寡。不可輕出”爲由希望皇帝收回成命，然後死守京師，崇祯不聽，加滿桂武經略銜，要他全權負責從後金軍手中奪回京畿百姓。
????滿桂遂率領宣大軍出城追擊後金軍，經過連番苦鬥後，滿桂奪回了百姓數千。可是幾經奮戰後，滿桂身上的箭瘡迸。可能是汗水引了傷口感染、也可能是有什麽衣甲上地髒物進入了傷口，他終于還是死在了關甯軍留給他的箭傷下。
????滿桂病死後宣大軍大亂，後金軍趁夜襲營，将宣大軍擊潰，此後再也沒有一支野戰部隊還能對後金軍進行追擊。
随後後金皇太極再次圍困北京，京城再次進入風聲鶴唳的狀态，用一日三驚形容絕對不過。
十一月中旬，宣大總督及宣府、保定、河南、山東、山西巡撫，奉旨率師入衛。山西巡撫耿如杞與總兵張鴻功也率五千人赴援。今日令守通州，明日調昌平，後日又調良鄉。駐地累更，三日沒有給軍饷，軍隊乃生嘩變。事後，耿如杞、張鴻功被捕入獄。時四方援兵先後集，以缺饷故，多肆剽掠。
山東河南援軍得到呂漢強留在附近商行五十萬糧草補給，拿着糧饷卻逡巡不前，眼睜睜看着後金建奴施虐京畿。
總而言之，現在的後金雖然沒了蒙古八旗助戰，但大明也沒了敢戰的的軍隊了。于是，一個百萬人口，彙集三十萬各地勤王兵馬和京營禁軍的京城，就眼看着後金三萬人馬，六萬包衣奴才呼嘯來去，經遵化源源不斷的将搶掠來的漢家人口财物運出關外。
滿桂的死訊傳回北京，崇祯的大殿内頓時又是一片死寂。
端坐在上臉色鐵青的崇祯，和站在大殿的五百羅漢就這麽眯着眼睛緊緊的閉着嘴巴，從天不亮已經站到了日正中。如果有人上殿，絕對會以爲他進了五百羅漢堂而不是金銮殿。
??????看着滿堂大臣，崇祯心中無限悲哀，他希望自己地平遼策略還是一點影子也沒有。這些日子，後金軍還在大明京師附近禍害地方百姓。想要募集兵馬再次勤王，但文臣們倒一直在爲幾年、幾十年、甚至幾百年後的大明可能出現的軍鎮隐患而争論不休。
還是崇祯先打破了平靜：“爲可能出現的軍鎮禍亂隐患而不能招募軍隊，京營不可用，勤王之兵不可用，那這天下還有可用之兵嗎？”
朝堂上寂靜了一會兒之後，朝臣們又開始争吵不休，互相推卸責任，但就是誰也說不出到底怎麽辦才好。
????“聖上，臣願意保舉馬世龍爲左都督，統一指揮勤王軍隊，将建虜趕出關外。”孫承宗聽到這個滿桂的噩耗後，就再次對皇帝建議使用馬世龍，他稱馬世龍也是一員征戰多年的宿将，應該比旁人更懂得打仗。
????崇祯看了看其他的文官們，一個個都說不出任何有份量的話，于是就無奈地說道：“那就傳馬世龍吧。”
????馬世龍來見過天子後，崇祯勉勵了他幾句，然後就讓馬世龍和孫承宗去讨論軍務了。他們走後崇祯又看了看死氣沉沉的大殿，心裏就像是堵了一塊大石頭那樣地難受。