軒轅見此，決心要解決此事，于是回到陳都，召集衆臣之中對醫藥養生比較有心得的岐伯、伯高、少師、少腧、腧跗、鬼輿、封距等人合力解決此事，這幾人都是在養生之道上有獨到見解的人，給了黃帝很多意見，讓黃帝收獲良多，黃帝又親上雷澤，求見伏羲之父雷神，求取養道全真及人體經絡之法，雷澤神自是傾囊相授。
此經八十一年，軒轅終于編撰完成了人族第一部醫學養生經典《黃帝内經》，在此書之中，黃帝不僅論治病救人之道，而且還論述了養道全形之法，包羅萬象，書成之日，隻見天降功德，比之當初神農完成神農本草經亦是不遑多讓，黃帝得此功德之助，修爲更進一步，隻待将黃帝内經傳遍人族，便可功德圓滿，證得聖皇道果。
在衆臣的幫助下，黃帝快速将《黃帝内經》傳遍人族，而黃帝軒轅在人族的威望亦是達到了頂點，黃帝軒轅見此，知道自己證道之日已近，于是命人在陳都外修建祭台，祭台建成之日，軒轅又焚香躬親諸天聖人。
這一日，陳都外人山人海，因爲今日便是人族共主軒轅證道之日，洪荒人族經曆過天皇伏羲及地皇神農之事，對此事已經習慣，而且黃帝功德無量，洪荒人族亦是爲他而高興，故此今日前來爲其祝賀送行。
待到日上中天，軒轅黃帝率領群臣登上祭台，周圍人族盡皆高呼人皇聖德，待到軒轅在祭台上站定，隻見紫氣東來三千裏，祥瑞漫天，天空中異香陣陣，卻是新進聖人倉颉前來，衆人參見，不一會兒，異象再起，地道聖人後土，人道聖人女娲，人教教主五行，魔教教主千煞，五莊觀與世同君鎮元子，紫微宮紫薇聖人等悉數到來，隻是三清聖人，西方二聖卻不曾到來，衆聖亦是知道原因，因此時辰一到，五行便吩咐軒轅大典開始。
這是人教大弟子行真子走出，張開一道法旨念道：“茲爾人族共主軒轅，自接位人族共主以來，立百官，興文字，創法度，麗九天而垂象；教稼穑，工算數，昭萬世以騰文。大勳纓垂曠典，華蓋絡結祥雲。下拯黎庶，上符昊命；恺樂九垓，澤被八纮，複又誅蚩尤，人族免于奴役，編經典，人族因之得以存命，功莫大焉，今受人教混沌無極太上教主五行道尊，人道混沌太上聖人聖母女娲娘娘法旨，封爲人族人皇，享聖皇道果，居三十三天外三皇天，爾其欽哉。”
行真子一念完，那道法旨便化爲一道紫氣鴻蒙的大道道基，莫入軒轅頭頂，随即隻見天空一聲巨響，天降功德，這卻是軒轅直立人族的功德，其中六成落入軒轅頭頂，隻見軒轅氣勢一路飙升，不過片刻，紫氣東來三千裏，一股巨大的威壓自軒轅身上升起，瞬間向整個洪荒壓去，洪荒之中凡大羅金仙以下，盡皆跪在地上，口稱聖人慈悲。即使是大羅金仙以上的準聖，也在這股氣勢的壓迫下彎下了腰，向着陳都行了一禮。
餘下的功德由輔佐軒轅的衆人共享，皆得到不少好處。
軒轅證道，隻見天空之中九條巨龍拉着一輛巨大的攆車緩緩而來，天皇伏羲與地皇神農自車中走出，先向衆聖行了一禮，而後對軒轅說道：“皇弟，此時不歸位，更待何時？”
軒轅呵呵一笑道：“多謝兩位皇兄前來迎接。”當下飛身進入車中，五行見此，衣袖一揮，那軒轅衆臣凡修爲有成的，除了人教弟子之外，盡皆不由自主的飛起，随着三皇往三皇天飛去。
大典既罷，五行便吩咐一衆人教弟子，即刻起各歸道場，非法旨不得再插手人族事物。而後對衆聖說道：“我等好不容易相聚，不如前往我那五行山，論道一番如何？”
衆聖自是稱善，往五行山而去。
且不說五行與衆聖論道，那人族在軒轅離去後，并未指定誰來繼位共主之位，後人族因見黃帝軒轅之孫颛顼賢，便推爲共主，颛顼乃是闡教大弟子廣成子的弟子，即位後立五官，嚴格遵循黃帝的政策行事，使社會安定太平。又有各種措施增強人族實力，功德亦是不小，但是卻在廣成子的蠱惑下刻意抹除人教痕迹，到了後期，又見九黎部落雖然歸附人族，卻仍然信奉巫族祖巫和人教教主，不敬三清，于是在廣成子設計下假娶九黎供奉九鳳大巫，卻在婚禮上使用盜來的左道宗師盤王的蝕巫丹将九鳳毒害，被九鳳拼死一擊而重傷，好在有治理人族的功德，雖然沒有殒命，卻修爲盡失，最後被三皇接往三皇天，成爲三皇五帝之中唯一一個毫無修爲的聖帝。
颛顼之後，喾、堯、舜先後爲人族共主，皆有大功德于人族，因此雖然并沒如三皇那般成就聖人道果，可是卻也達到了至人巅峰，又有功德相助，即使是聖人也要禮敬三分。不過由于三帝皆是三清門下，故此在位期間皆盡力抹除人教痕迹，因此慢慢的除了三皇時期便存在的人族外，新生的人族已經很少知道人教之事了。
到了舜帝後期，由于妖族之中出現了一個大妖，這大妖乃是洪荒四大靈猴之意的赤尻馬猴，修爲高絕，已然有了準聖初期實力，聚集了一大批沒有躲入北俱蘆洲的妖族，在人族爲禍，更是攪動黃河與淮河之水，使得水淹洪荒，三教弟子雖然不乏準聖，但是卻不及這赤尻馬猴天生神通，尤其是這赤尻馬猴一旦不敵，便躲入水中，他在水中神通大漲，三教門下準聖竟然不能制，使得大水淹沒人族之地。
舜帝無法，命大賢鲧前去治水，鲧治水之初以堵爲法，取得了不小的成果，可是此次洪水乃是妖族爲禍，尤其是能夠堵得住的，因此不久後，鲧便發現洪水反而愈發厲害，這時洪荒人族遭此大禍，盡皆前往陳都見瞬，請求舜帝治水，面對民情激憤，舜帝無法，隻得斬殺鲧來平息民憤。
就在舜帝要斬殺鲧之前，五行山那已經将近萬年未曾打開的山門卻是打開了，一個身穿紅色道袍，滿頭紅發，渾身散發出一股股潇灑飄逸卻又混沌古遠的氣勢随着接引的行真子往山上走去。