而且三清對道的理解也不相同，長期居住在一起，沒成聖之前尚可，可是一旦成了聖，那矛盾必然爆發。就拿收徒來說，元始天尊講究資質根性，所收弟子乃是先天靈物化形，資質五行俱佳。而通天教主講究爲衆生截取一線生機，因此隻要願意拜入他們下的，盡皆收下。其中不乏披毛帶甲的妖物，很多都還是沒有化形的，或者化形得不甚完全。這讓一向自命盤古正宗，看不起披毛帶甲之輩的元始天尊如何能夠忍受？
而且通天教主所收弟子之中，雖然有不少根行深厚，心性資質俱佳之輩，如其内門四大弟子多寶，金靈聖母，龜靈聖母，無當聖母，以及外門之中雲霄，趙公明等，無一不是上上之選，可是收徒衆多，其中自然不乏不修心性道行，好勇鬥橫，胡作非爲之輩。這又使得元始天尊更努。時時以此抨擊通天教主。
通天教主乃是高傲之人，如何能夠忍受，剛開始時顧念着兄弟情義，這才讓着元始天尊。可是元始天尊亦是知道三清終要分家，到時候這昆侖山歸誰所有卻不好分說，他乃是知道通天教主性子的，因此更是逼迫不已，隻望着通天能夠自動離開昆侖山。
而老子雖然多方調和，一來老子所修乃是無爲之道，不欲管得過多，再說原始乃是有心爲之，又如何能夠調和得了，時間長了，老子亦是心灰意懶，不願再多說。而且通天座下弟子多有無法無天之輩，老子亦是甚爲不喜，故此心中對通天也有幾分不滿。遂不管他們之事，隻是一心教導弟子玄都。
師長如此，門下弟子自然不會和睦相處。那元始天尊經過千挑萬選，選得十二親傳弟子，乃是九仙山桃源洞廣成子，玉泉山金霞洞玉鼎真人，五龍山雲霄洞文殊廣法天尊，九宮山白鶴洞普賢真人，乾元山金光洞太乙真人，青峰山紫陽洞清虛道德真君，太華山雲霄洞赤精子，夾龍山飛雲洞懼留孫，普陀山落伽洞慈航道人，金庭山玉屋洞道行天尊，崆峒山元陽洞靈寶大法師，二仙山麻姑洞黃龍真人，此外尚有終南山玉柱洞雲中子，蓬萊山長春洞南極仙翁等。局勢氣運深厚，根性上佳，資質可喜之輩。
這些弟子之中，除了雲中子，南極仙翁外，盡皆對截教諸徒看不上眼，動辄以畜生稱之，元始天尊又有意縱容，更是助長了他們氣焰。
通天門下雖多胡作非爲之輩，可是截教弟子對于同門之宜一向看重，多寶等弟子本是連着三清一家，多有忍讓，奈何原始門下逼迫太甚，時間久了，難免有那忍無可忍之事，故此兩教弟子卻是漸漸第争鋒相對起來。
不過與十二親傳弟子不同，雲中子卻與多寶等交好，也曾勸谏原始天尊，奈何元始天尊豈是一弟子能夠勸得動的，不僅如此，反倒使得雲中子在原始面前失了寵，衆師兄弟也多與他生分。
雲中子卻渾不在意，對原始一如既往尊重，對衆師兄弟亦是以禮待之，原始雖然甚惡他，可是通天與老子看在眼裏，卻是多有贊歎，以爲能興闡教者，必是此子。因此到對他多加指點，這倒使得雲中子雖然不得原始歡喜，可是道行修爲卻也隐隐居于衆師兄弟之上。
闡教弟子多方挑釁，截教弟子本就是好勇鬥狠之輩居多，終于前番再忍耐不住，便出手相向，闡教弟子自是不怕。奈何截教弟子甚是團結，一出手便是一擁而上，而且截教四大弟子和雲霄趙公明等修爲都是在在闡教十二弟子之上，闡教衆人自是不敵，截教弟子雖然不敢下死手，可是多年來所受之氣，此時盡皆發洩在闡教弟子身上。等得元始天尊和通天教主聞訊趕來，隻見十二弟子盡皆被打的鼻青眼腫，有幾個還受了重傷，截教弟子雖然也有幾個受傷，可是比起闡教弟子來，無疑要好看許多。
元始天尊見此，隻氣得滿臉鐵青，恨不得出手将截教弟子殺個通透。通天見門下弟子如此争氣，雖然心下歡喜，可是卻也顧及原始臉面，假意教訓弟子一番，将他們都送回了各自洞府。原始見此心下大怒，喝道：“通天，你看你收的這些畜生，成什麽體統，直将我這昆侖山搞的烏煙瘴氣，實在可恨。”
原始此言一出，通天氣的須彌山都紅了半邊，厲聲喝道：“元始天尊，好沒道理，安敢如此罵我門下弟子。你罵他們是畜生，那豈不是說我這個做老師的也是畜生了，你我同源而生，我是畜生，你又是什麽東西。好個大言不慚的東西，這昆侖山幾時便是你的了，如此不要面皮。”
一番話說得原始滿面通紅，正在這時老子走來，聽了原始之言，亦是心中不滿，同是三清，原是将昆侖山看着是他的，那豈不是說自己與通天教主都是寄人籬下之輩嗎？不過他乃是心思深沉之輩，也不言語，直走了過來。
通天見老子過來，說道：“大兄來得正好，剛才原始天尊言這昆侖山乃是他的，那我便與了他，自找他處而居，從此與他原始再無情分。”通天此言一出，元始與老子盡皆大驚，原始雖然想趕走通天老子，可是卻萬萬沒有想要斷絕兄弟情分，如今通出這等話來，他如何能夠不驚，待要開口，又覺得放不下面皮來，隻得看向老子。
老子歎了口氣說道：“三弟，我等終是億萬年兄弟，這情分豈能說斷就斷，罷了，這昆侖山終是不能承受你我三人氣運，二弟既然有意這昆侖山，那我兄弟二人就自去尋找道場吧，也免得居住在一起壞了情分。
通天聽了老子之言，怒氣稍消，想起多年兄弟情分，若是真個斷了，終是不美。便道：“如此便依大兄。”
元始老子這才松了口氣。這是通天将自己弟子全部召來，轉身對元始老子說道：“二位兄長，那小弟便去了。”說完不管黯然不已的二人，自帶了弟子往東海而去。
看着通天孤傲的背影，原始和老子心下亦是不好受，原始通天二人雖然相鬥，不過乃是對道的理解不同而已，億萬年相伴，這情分豈是沒有的。
見通天走遠，老子說道：“二弟，這次卻是你過了，也罷，爲兄也離去吧。”
說完亦是招了玄都離去，離去之前确實對南極和雲中子說道：“你二人有時間可來我道場聽道。”
就這樣，才出現了令人震驚的三清分家之事。