正因爲有這麽一個草率的心态，相比于偷襲珍珠港，中途島的戰前準備顯得異常忙亂和粗糙，組織策劃者全都跟慌腳雞似的，愛摳細節的好習慣也在不知不覺中被抛到了九霄雲外。
保密是重大戰役開始之前的頭等大事，比如偷襲珍珠港時的保密措施就極其嚴格，山本甚至把聯合艦隊的無線電密碼整個換了一遍。
到中途島戰役之前，山本都被操心過密碼，因爲從5月1日起，日本海軍高層便更改了密碼本，決定啓用新密碼。可是，如何使用新密碼，以及把更改後的密碼本發下去，這些活兒都得有人做，此時聯合艦隊司令部的大大小小、老老少少忙得不可開交，誰也顧不上什麽密碼不密碼，結果導緻新密碼本的使用日期一拖再拖，從5月1日一直推到了6月1日。
也就在這短短的一個月裏，日本海軍百分之九十的重要密碼電報遭到破譯。雖然“魔術隊”已經拿到破譯日軍密碼的金鑰匙，但如果他們及時換新密碼，也不可能這麽輕而易舉地被破譯——新密碼直到啓用幾個星期後，才被“魔術隊”破譯。
可歎的是，日本海軍的情報專家們一邊被蒙在鼓裏，一邊還自得其樂，以爲他們的密碼仍處于絕對安全狀态。
進攻中途島的計劃或許得到密電裏去找，聯合艦隊将出海作戰的意圖卻幾乎是毫無秘密可言。海軍基地的日軍戰艦出出入入，跟趕集似的，爲航母運送備戰物資的船隻更是每天頻繁來往于艦隊與港口之間，一眼看過去，船上裝的全是冬季服裝和耐寒裝備。
現在夏天還沒到，傻子都知道他們要到哪裏去了。一位海軍軍官到理發館刮胡子，竟然有理發師問他：“這回你們要出去打一個大仗，是嗎？”
對比偷襲珍珠港時的謹慎和僞裝，淵田感到十分困惑：小道消息竟然比公函來得還要快，這也太不像話了吧。
到了5月中旬，小道消息已經像長了腿一樣不胫而走，就連夏威夷的檀香山大街上，都開始流傳日本要攻打中途島的消息，而這跟密碼破譯可毫無關系，完全都是口耳相傳的結果。
聯合艦隊偷襲珍珠港時，依靠吉川猛夫等間諜内線，幾乎每一步安排，都能以确鑿的第一手情報爲依據，可到中途島這裏就瞎了。
珍珠港事件發生後，美國政府便在内部采取了嚴格的整肅措施，不僅吉川這樣的人再無藏身之處，就連普通日僑也被發了火的美國人統一送進“軍事區”關了起來，别說打探情報，人身自由都受到了限制。
夏威夷的美國報紙跟着機靈起來，再不刊登太平洋艦隊來來往往的消息。日本情報部門一絲一毫有價值的情報都得不到，也始終未能破譯出美國海軍最高層所使用的密碼，當然更不可能告訴聯合艦隊，敵方的軍艦會在哪裏出沒，數量有多少。
除了沒有情報作爲依據外，中途島作戰方案本身也充滿了想到哪兒做到哪兒的行事風格。中途島戰役的運送補給拟由第四艦隊擔任，聯合艦隊派軍需去和艦隊司令長官井上成美聯系，井上對第四艦隊的運輸能力尚存顧慮。本來雙方可以有話好好說，但軍需參謀根本沒有耐心，當即就憤然離去，臨走時還扔下一句硬邦邦的話：“既然不能依靠第四艦隊，我們隻好把這個任務交給陸基航空兵去完成。”
牛不喝水強按頭，聯合艦隊一副強買強賣的樣子，讓人家運送補給是如此，調集兵力也是這樣。南雲的機動部隊已在印度洋打了三個月，剛剛才返回日本國内不久，人困馬乏，理應休整一段時間，可是山本不由分說，就把他們硬按進了“東進”的戰車。
機動部隊丢下耙兒又要弄掃帚，累得夠嗆。不過對于這一點，南雲倒也沒多大怨言。自從英國遠東艦隊覆滅之後，在印度洋海域，已經沒有任何敵手可以跟日本的機動部隊相抗衡，南雲在那裏就像是用大棒槌砸雞蛋，這無疑更助長了他身上的那股子狂勁兒，以至于出門進門都是一副灌了黃湯的感覺，全不知天有多高，地有多厚。
士兵是不是疲憊，方案是不是周全，作戰會不會失敗，這些全都被南雲抛至腦後，他腦子裏能想到的隻有一個，那就是如同偷襲珍珠港時一樣，把太平洋艦隊打個稀巴爛。
照例，戰前要舉行圖上演習，這是戰役組織中極爲重要的一環。參加演習的高級将領大多氣壯如牛，尤其是機動部隊的軍官，全把自己當成了高大全的典範。南雲的參謀長草鹿龍之介甚至揚言：“隻要有機動部隊打先鋒，什麽敵人也不在話下。”
當演習總裁判宇垣纏詢問機動部隊航母上的飛機全部出去空襲後，該如何保護航母群時，南雲的首席幕僚源田實脫口而出：“铠袖一觸！”
這是一種日本的說法，意思是無堅不摧，不用怕我們挨揍，隻會是我們揍别人。
源田不僅号稱機動部隊乃至聯合艦隊的智多星，他還是偷襲珍珠港計劃（即“Z”計劃）的起草者之一，被許多人看成是日本海軍的希望，他都把話說到了如此地步，怎由得宇垣不激動？
宇垣的正式職務是聯合艦隊參謀長，頭腦和口才都不錯，也被稱爲是日本海軍在戰略方面的權威。這其實是一個和源田很相像的聰明人，但從山本、南雲開始，到宇垣、源田，此時似乎都由聰明人變成了莽漢，一個個都表現得忘乎所以，大意輕敵。
身爲演習總裁判，演習過程中隻要“日軍”遇到一點困難，宇垣就會毫不猶豫地動用手中的權力，讓“日軍”輕松過關。
盡管如此，令宇垣擔心的場面還是在演習中出現了，并成爲“日軍”難以繞過的一道坎——機動部隊空襲中途島，島上的陸基轟炸機不可能不反過來轟炸航母群。
如何确定艦群的受損程度，需要按照戰場實情及雙方的火力對比來判定，然而宇垣爲此制訂的規則非常無厘頭：擲骰子！
擲就擲吧，裁判擲出來的結果是：日本航母中彈九次，有兩艘航母被擊沉。
骰子擲得不如意，宇垣不爽了，他立即宣布裁決無效，說怎麽可能有九次中彈呢，不算！照我說的，三次中彈，兩艘航母一沉一傷。
到了第二階段圖上演習，衆人吃驚地發現，曾被宇垣判定爲沉沒的那艘航母居然又不聲不響地從海底複活了，并且參加了新的戰鬥。
賴皮到這種程度，誰還玩得過你？于是“美軍”很快便招架不住，“日軍”一路得勝，連小挫折都沒碰上過一次。
演習雖是假的，但它是對未來真實情況的模拟，最後搞成鬼不成鬼、賊不成賊的樣子，不過是在自欺欺人而已。
淵田如此評價這種幾乎要笑掉大牙的荒唐演習：“真不知羞恥，就是臉皮最厚的飛行員見了，也一定會驚得目瞪口呆。”
參加演習的許多軍官并不是都看不出問題，但沒有人敢在會上公開提出來，都怕被說成是膽小畏縮。
有人小心翼翼地建議對計劃做一些修改，并且希望能推遲作戰，以便有更多時間進行準備，宇垣一律答複：“辦不到！”
對着真人不說假話，宇垣是真着急，恨不得第二天就跟着山本登上中途島。他在日記中寫道：“現在耽擱一天，将來要後悔一百天。”
在一片響亮的口号聲中，四天的圖上演習就這樣草草結束了。會後才有一幫人叫嚷起來，而且叫得最兇的，正是會上胸脯拍得最響的機動部隊。