雖然他并沒有上陣殺敵建功立業，可爲了朱慈烺的南征北戰保駕護航，也立下了不少的功勞。十二團營南下之時，李自成也曾派人刺殺過朱慈烺。
在暗衛孟樊超和親兵隊長杜忠仁的保護下，朱慈烺數次化險爲夷。
朱慈烺“哦”了一聲：“對付李自成水師，用什麽辦法？”
杜忠仁站了出來，拱手說道：“太子殿下，闖賊得洞庭水師，其戰船不下百艘。加上大小民船，四五百搜是有的。而咱們，則一艘戰船都沒有，可是洪湖離着洞庭最近。咱們可以調撥洪湖戰船，再征收長江沿岸所有的戰船。當可與闖賊一戰。”
朱慈烺皺了皺眉頭：“咱們沒有水師将士，僅有戰船又有何用？”
杜忠仁微微一笑：“江南子弟，又有誰不會水性。隻要精通水性，便可與闖賊一戰。重要的，殿下忘了，咱們還有火器。”
“殿下，末将認爲杜隊長的計劃可行。調撥長江各地船隻，不管大小戰船全部征收過來。”
“對，咱們沒有水師，闖賊也不過是一群烏合之衆。末将覺得，咱們還有機會。”
“咱們可以把紅夷大炮搬到船上，流寇雖有戰船，然無火器。一旦開戰，他們根本就不是咱們的對手。”
洞庭湖是長江邊上的一個天然湖泊，洞庭湖對長江的水給下遊起了一個緩沖調節的過程。也是長江水的一個很大的水源。
大明水師雖然沒落，可是長江沿岸的戰船尚在。而且，船隻經水路運行速度也快。隻需兩到三個月，朱慈烺很快就能組建一支屬于自己的水師。
“杜忠仁，你會水麽？”朱慈烺問。
杜忠仁點點頭：“小人略識水性。”
“好，本宮就任命你爲水師提督，三個月之内，打造戰船八百艘，可有問題？”
杜忠仁想了想：“報殿下，沒問題！”
兩個月後，杜忠仁回來了。這兩個月内，李自成數次發動沖鋒，可是始終跳不出朱慈烺的包圍圈。
當真是過街老鼠人人喊打，官兵羸弱的時候，李自成所向披靡。十二團營能打的時候，這些地方官兵似乎也打了雞血一般。
李自成南下廣西，被廣西總兵穆文龍堵了回去。穆文龍以獠人弓箭，上染劇毒，李自成的部将中箭者，多感染而死。
後來才知道，穆文龍用當地土著常用的方法，在弓箭手淬毒。或者，用人畜糞便。弓箭射中人體之後，很快就會繼發感染。在沒有抗生素的時代，很容易造成将士們死亡。
李自成南下廣西吃了大虧，隻能調轉槍頭，往江西逃竄。
可惜，江西方向早就被宋獻策組織當地地方武裝，配合東宮衛嚴陣以待了。李自成剛一突圍就暗叫不妙，差點栽在了宋獻策爲他準備的口袋陣中。若不是自己發現及時，更是會吃大虧。
沒辦法，李自成隻能退回洞庭湖。實在走投無路，東南北三個方向，都被明軍官兵合圍。唯一的出路，似乎就是西進四川和貴州。
偏偏，四川和貴州是張獻忠的地盤。李自成想進入張獻忠的地盤，張獻忠就送他兩個字，不準。
此時的李自成隻能被動哀求，大家都是一根繩上的螞蚱。官兵滅了我，下一個就是你張獻忠。
誰知，數次在李自成手裏吃過虧的張獻忠，這次死活不同意李自成兵進四川。
首先，李自成手裏還有五十萬兵馬。一旦進了四川，恐是引狼入室。二者，讓官兵和李自成打個兩敗俱傷，他張獻忠就可以坐收漁翁之利了。
李自成自然是恨恨不平，于是不管不顧的想帶大軍兵進四川逃難，結果，反被張獻忠帶人打了一架。
李自成暴跳如雷，這簡直就是落井下石。自己都被官兵逼到這個份上了，張獻忠還來給自己背後捅一刀。
可張獻忠手下猛将如雲，李自成在和官兵的對陣中又元氣大傷。此時的他打不過張獻忠，隻能又被逼回了洞庭湖。
兩個月後，朱慈烺的水師成立了。水師人數很多，足足有五萬餘人。爲什麽這麽多，沿途俘虜的流寇，再加上征集的兵勇。
不得不說，這個杜忠仁還真是個人才。他短短兩個月的時間，就組織了五萬餘水師。而且，擁有戰船八千餘艘。
這着實把朱慈烺給驚着了：“杜忠仁，你說什麽，多少艘戰船？”
杜忠仁笑着說道：“回殿下，不多，大小船隻八千三百一七九艘。兵勇合計，五萬六千三百餘人。”
朱慈烺倒吸一口涼氣：“你哪兒來的這麽多人。”
“招的啊，長江沿途的船隻都被征收了。還有，屬下也在不斷地招募兵勇。這些人都說被闖賊禍害慘了，一聽說是打流寇，都紛紛跟着參加了。”
這與朱慈烺的認知并不太一樣，不是說李自成振臂一呼應者雲集。百姓們痛恨官兵，紛紛參加起義軍麽。
爲什麽現在的形勢倒過來了，官兵所到之處受到擁戴。而李自成則成了過街老鼠，人人喊打的份上了呢。
其實成王敗寇，此時的李自成一敗再敗，那裏還有什麽軍紀約束。敗軍不如寇，流兵即是賊。一敗再敗後的流寇，每到一地又開始無差别的搶劫擄掠。這給當地的百姓，造成了嚴重的災難。
于是，這些長江沿岸的百姓對流寇無不恨之入骨。一聽說官兵來剿寇，百姓們紛紛支持。是以杜忠仁征收船隻的工作空前順利，短短兩個多月，朱慈烺就有水師五萬餘人，船隻八千餘艘。
反觀李自成，他僅有四五百艘戰船。雖然官兵征收的大多都是一些小船隻，可八千餘艘的戰船在湖面上一字擺開。區區李自成的幾百艘戰船，根本就不堪一擊。
随着官兵的包圍圈越縮越小，退無可退的李自成決定先發動水戰。然後以此打開突破口，意圖沖出朱慈烺爲他設置的包圍圈。