李志明算是趕上了末班車，他進入自然科學研究院的時候已經年紀不小了，但他一路飛黃騰達，短短時間内就爬到了行政部部長和副院長的位置。這不能說絕無僅有卻也是在組織内十分罕見的，尤其是如今的自然科學研究院早已超脫了一個異能組織這麽簡單的身份。大多數旁觀者隻能對李志明的站隊能力和判斷預見性望塵莫及，實際上李志明屢屢押對寶走對棋，着實讓人無法感歎這隻是運氣所緻。
誰也不知道，其實這一切源于李志明收到的信号。那一年他剛剛進入自然科學研究院，正在執行任務的時候他突然暈厥昏倒，然後就昏迷了三天，這三天裏他做了一個夢，夢到了未來的自己，也看到了末日的景象。如果所夢到的一切都是真的，他與未來的自己不是兩個位面兩個平行時間不交融的個體，而是時空回逆的結果。那麽未來的自己就把希望寄托在了回逆的自己身上，如果李志明改變了當下，那麽未來就會因此改變結局。
李志明清楚他不是在拯救别人，而是在拯救自己，或者說是拯救當下的自己。未來的自己已經生命垂危，而且早已是油盡燈枯，即便自己改變了曆史，他依然還是個老頭。但他不想讓悲劇重演，或者說他想讓時空回逆中的自己能夠不再遺憾。
無論是未來還是現實，自己的目的就是救活藍衫，而人死不能複生，除非回到時光逆流中的過去，在時空回逆中拯救藍衫。李志明在初次嘗試未來經驗後喜不勝收，因爲事實證明一切都是真的，夢果真來自于未來。借助着未來自己對時局的預知以及組織内的内部更替與權力鬥争的已知結果，李志明每次都押對寶辦對事，雖然他發現因爲自己的錯位幹預，導緻很多事情發生了蝴蝶效應般的改變，但曆史的修複能力還是會讓很多事情發生，其結果大同小異，這便讓他更加如魚得水了。
不過他還是有些擔憂，擔心最後的自己也會如同修正的曆史一般逃不過宿命。不過起碼現在李志明更早的當上了部長和副院長，也有了相比未來更大的權力。大權在握後，太歲計劃更加順利的研發了，與曾經曆史一樣的是三戰的到來，不過起因略過異電萃取技術直接指向了太歲計劃。
而叛逃者仍然出現了，隻是換了一個人，原先的人被李志明秘密處決了。有了來自未來的記憶，李志明帶領自然科學研究院的人少走了很多彎路，他也在組織能獲得了更高的聲望。李志明需要太歲計劃，裏面有自己渴望的能力，那是穿越時空，讓時間回逆的東西，隻是這個部件掌握在黑雅手中。
後來通過一系列操作和交換，以及李志明從中的相互瞞騙自然科學研究院得到了這個部件，并在吳用的帶領下研制出了可以穿梭時空的機器。而李志明發現正如未來所說的那樣，自己是光的使者、空間的締造者，使用自己的異能可以做到穿梭平行時空後更高一層的時空回逆。這種空間能力被研發部複制了下來，并利用機器取代，雖然效果不是那麽好，但主動權不再獨掌于在李志明手中了。
自然科學研究院的穿越隻是爲了了解曆史，至于時空回逆隻是保留在最後的殺手锏。破壞其他位面平行世界的曆史造不成什麽影響，但時空回逆就不同了，它會造成很嚴重的後果，所以這項技術一經掌握就立刻冷藏了。所謂限制不如徹底斷絕來的幹脆，人的貪心是無法滿足的，有了第一次穿越的甜頭便會想第二次。
時空回逆聽起來神奇，但細細分析起來卻極其恐怖，稍有不慎可能導緻整個人都不存在了，而蝴蝶效應所緻會在一定程度上改變曆史，甚至可能導緻自然科學研究院的徹底消失，這些都有可能，這令組織忌憚也使當權者恐懼。
想要修正？讓事情回到本來的樣子？那便需要再一次穿越，而時空回逆的穿越需要平行錨點準确的落在自己這個世界位面的曾經，這種穿越難度極大危險系數也很高，稍有不慎就會連人帶時光機迷失在時空的長河當中。況且誰知道這種穿越會不會遺漏什麽，再度引發大的蝴蝶效應呢？誰也不敢冒這個險，如今的局勢挺好，又何必冒險呢？
這次李志明失算了，他原以爲借助組織獲得時空回逆的科技，然後就可以憑借自己在組織内的權力救回藍衫，結果他卻發現一切并沒有自己想象的那麽簡單，而所受的阻力也是超乎想象的，手中的權力更沒有自己估計的那樣高。六老和另一個副院長蔣傳芳此刻站到了一起，徹底冷藏了穿越技術，聲稱不到萬不得已不可使用。
李志明開始預謀自己偷偷使用機器甚至制造另一個時空穿越器，畢竟最難的在于時空回逆而不是穿越本身，隻要連接他的異能他就能做到，故此僅發明一個時空傳送機對組織内盟友吳用來說不是什麽難事。至于消耗巨大能量之說，以李志明目前的身份地位，想要瞞天過海是輕而易舉的。但屢屢穿越後，藍衫還是無法複活，他這才發現有人在阻撓着他。
他剛拯救了藍衫，回來後記憶發生改變，但藍衫依然死于疾病和災難。他發現每每他前腳穿越，後腳就有人再度改變曆史，而阻止自己的正是自然科學研究院的同僚。後來李志明才知道，這些同僚他們經過分析得出一個結論，如果藍衫還活着李志明就不會天天抑郁，繼而産生異能的改變。如果李志明沒有異能突變，或者說晚一些發生異變，很多事情就不會發生，甚至連太歲計劃的開發都會受到影響，這就對觸犯很多人的利益，此刻過往的重要和優秀反而成了阻礙和他人阻攔的理由。
李志明悲憤交加卻又無力抵抗整個組織，而他穿越的權力也被監控，爲此還牽連了幾個忠心耿耿的手下，若不是有人替李志明抗罪，隻怕李志明便會被群起而攻之成爲衆矢之的。攘外必先安内，一場内部的政治鬥争開始了，李志明甚至不惜拉攏黑雅和卐達到自己的目的。
他成功找到了海赫和遊魂，并注意未來失敗的緣由盡量避免，神不知鬼不覺的把兩人歸爲自己麾下，同時聯絡翟清，四人與三大組織提出了條件。四人的組合讓太歲計劃得到了極大的開發，然而三大組織卻在各自得到自己想要的技術後，同時做出了撕毀條約的無恥舉動。李志明太天真了，這種三大組織的連環擔保在連環否認後變得毫無作用。最終翟清被俘，海赫與遊魂依然沒有逃離肉體毀滅的結局，而李志明則帶着死黨進行着最後的反抗。
由自然科學研究院分裂開始，第四次世界大戰拉開了序幕。曆史的修正讓這場毀滅世界的大戰依舊發生了，隻是由于李志明的幹預它提前到來了，最終的結局也不是核戰引發的，可以說未來的李志明最不希望的世界毀滅，反倒是讓過去的自己給推動了進程。
大戰中虛實組成的數碼怪獸，反制怪獸所用的全境幹擾波，傀儡軍團的勇往直前和靈魂力量的波動武器，這些在未來沒有出現過的高科技武器紛紛登場，大家互相制約相互打擊，誰也沒辦法全面擊潰對方。
然而作爲底子最薄實力最弱的李志明等人，又是出頭跟三方談判或者說“要挾”的人，是首當其中被三方共同火力“照顧”的對象。所以三方互相制約各有勝敗，但李志明一夥卻是最先被打的支離破碎的人，不過因爲在戰時，還得提防其他人，故此對李志明的追繳也是不緊不慢的，這倒是給了他活下去的機會。
李志明自然不甘于此，他找到了追随自己的吳用，告訴了他們關于未來的秘密。吳用将信将疑，最近他和蔡楓以及程商等人的情緒很大，畢竟本來位高權重的他們，如今卻成了組織公敵，隻能惶惶不可終日宛如下水道的老鼠一般見不得光。這樣的高低落差和地位變化是他們所不能接受的，而相互之間感情的不牢靠在大難臨頭之日發生了變化，他們幾個尚且如此，他們各自的屬下就更加人心惶惶各有心思了。
李志明對他們坦誠了未來，而他們則懷疑曆史變化後的未來後果。于是一場秘密試驗開始了，吳用的智慧的确非常人可以比拟，他通過技術手段，刺激李志明異能變化，使之有了飛躍式的提高，于是他們順利突破了穿越的難題——隻能回到過去不能前往未來。
時間鎖定在了五年之後，在那裏他們看到了一副令人難以想象的場景，世界百分之八十的土地再次被海水淹沒，剩下的則是荒漠和城市廢墟。人類早在兩年前的太歲爆發中死去大部，地球依然毀滅了，無法治愈的病毒，突然成爲數碼消失的山川河流，愈發惡劣的自然環境，這些不可思議的事情接連上演。
隻是由于人類的科技要比原先的未來還要強大，故此有人逃離了地球，在幾年前修建的太空基地上生存着。但逃離地球的人隻是少數，甚至不足十萬分之一的數量，大部分人依然是這場慘劇的受害者。
他們回到了自己的基準時間，每個人都沉默了，好像無論是未來還是改變後的未來，世界的毀滅都無法阻止。每次的改變隻能讓災難更加提前的降臨，而到那時每個人都是受害者，即便他們能夠去外太空避難，但他們的家人親朋卻依然會死在浩劫中，而每個人的夢想也就此終結了。
李志明喊出了大義凜然的口号，他要拯救這個世界。于是，他們的計劃開始了，一年後，自然科學研究院捕捉到了一段穿越信号，但追随信号反穿越的追殺中卻迷失了方向。自然科學研究院的工作人員驚奇的發現，李志明他們穿越到了一個平行的世界，他們究竟要做什麽！三方停戰了，他們共同對付起了李志明，因爲這種穿越的未知讓他們感到不安。