受到影響最大的當然是太平天國自身，在太平軍各大軍頭軍閥化早已十分明顯的前提下，這個事件無疑直接導緻了太平軍的徹底分裂。雖然大驚失色的楊秀清在第一時間發表聲明，矢口否認吳如孝對自己的一切指控，宣稱吳如孝和葉芸來爲叛逆，要求各地太平軍出兵讨伐，然而除了幾個楊秀清的死黨鐵杆之外，大部分的太平軍軍閥都選擇了擁兵觀望，也紛紛與吳如孝取得聯絡，了解事情真相才做出反應。
很快的，繼葉芸來之後，常州的太平軍守将黃子潮也選擇了起兵讨楊。守蘇州的譚紹光和松江的陸順德再三确認了吳如孝的證據不假之後，也先後打出了讨楊旗号，雖然沒有直接出兵給吳如孝和葉芸來幫忙，卻也乘機擺脫了楊秀清的控制指揮，正式割據一方。
目前駐守揚州的楊輔清因爲是楊秀清族人，也堅決不信楊秀清會背叛太平天國，選擇了南下勤王，幫着楊秀清暫時擋住了吳如孝和葉芸來的軍隊，也給措手不及的楊秀清争取到了至關重要的應變時間，忠楊派與讨楊派在鎮江瓜洲一帶大打出手，厮殺得不可開交。
乘着楊輔清暫時擋住吳葉聯軍的機會，楊秀清除了積極備戰之後，自然也全力争取上遊太平軍諸将的支持。結果在楊秀清使者賭咒發誓的保證下，從金田起義開始就一直都是楊秀清嫡系的太平軍大将黃文金倒是選擇了繼續支持楊秀清，然而所處地理位置更加重要的林鳳翔和林啓榮卻是繼續持保留态度，既沒有出兵讨楊，也沒有繼續向楊秀清表示效忠，一起選擇了全力争取與吳如孝取得聯系，了解事情真相。
山頭林立的北線太平軍各大軍頭也因此陷入分裂，對楊秀清忠心耿耿的李開芳根本不相信吳如孝使者的任何解釋，果斷選擇繼續忠誠于楊秀清，還在第一時間親自率軍增援楊秀清。同樣對楊秀清忠貞不二的吉文元也是如此，隻不過吉文元軍肩負抗衡山東清軍的重任，沒能出兵南下，隻能是發聲支持。
讓楊秀清十分火大的是，太平軍各大軍頭中曾經與他關系最鐵的石達開，這次竟然選擇了擁兵觀望，沒有在第一時間表态支持于他，正在跟着石達開讨伐翁心存父子的曾立昌和李世賢部也是如此，還一起表态願意惟石達開的馬首是瞻，抱團觀望，隐隐與楊秀清形成了分庭抗禮之勢。
在此情況下，楊秀清的最好選擇當然是速戰速決，乘着太平軍各大軍頭還沒下定決心起兵讨伐于他的機會，趕快消滅吳如孝和葉芸來毀滅證據。爲了做到這點，楊秀清也派出了自己麾下的精銳嫡系東進，與楊輔清軍聯手猛攻鎮江，然而很遺憾的是，因爲在北伐大戰中嫡系損失慘重，再加上久居南京繁華之地戰鬥力蛻化，楊家軍雖然向鎮江發起了多次進攻，卻始終無法迅速攻破鎮江消滅葉芸來，吳如孝軍則積極西進幫助葉芸來分擔壓力，争取時間等待其他的太平軍軍頭做出反應。
與此同時，楊秀清當然也沒忘了吳超越這個最大的上遊威脅，在局勢已然是危如累卵的情況下，楊秀清自然也不敢再夢想什麽聯清抗吳，老老實實的派遣心腹候仁寬趕來湖北與吳超越聯系，聲稱吳如孝和葉芸來等人對自己的指控純數污蔑，自己絕對沒有和滿清朝廷有任何的勾結，表态願意與吳超越繼續聯手滅清，也要求吳超越對太平軍的内戰保持中立，不要爲葉吳叛軍提供任何的支持幫助。
楊秀清的動作明顯有些嫌晚，當他的心腹候仁寬還在急匆匆趕來湖北的途中時，滿清朝廷此前派到湖北的使者景壽早就開始了勸說吳超越出兵東進，天天都跑到吳超越的元帥府門前請求召見，也每次見到吳超越都極力勸說吳超越趁火打劫，乘機出兵攻打太平天國奪取江南膏腴之地，并表示隻要吳超越對太平軍下手，不管什麽條件都可以商量。
因爲機會實在難得，吳軍内部也有不小的趁火打劫呼聲，甚至就連趙烈文和閻敬銘等吳軍重臣都建議吳超越不妨考慮一下先滅太平天國，奪占江南繁華之地，然後在地理位置更加優越的情況下發起北伐。
是人都有私心，如果說吳超越沒有對趁火打劫這個提議動過心那是假的，尤其是在吳軍已經秘密做好東征準備的前提下，趁火打劫奪取江南實際上就是吳超越一句話的事。然而民族大義這四個字卻攔住了吳超越，也讓吳超越在猶豫再三之後，下定了決心決定對太平軍采取中立。
在宣布自己這個重大決定時，吳超越召集了趙烈文、閻敬銘和錢威、王孚等絕對心腹，向衆人傾吐了自己的心聲，道：“衆位，我知道現在機會難得，長毛内亂，互相攻伐，我們出兵東進消滅長毛不但把握極大，還可以獲得江南富庶之地。但是，我還是決定放棄這個機會。”
已經熟知吳超越性格的趙烈文等人保持沉默，耐心等候吳超越解釋原因，吳超越也自顧自的直接說道：“我是這麽想的，假如我們現在把主要力量用于東線戰場，會出現什麽樣的情況？”
“首先第一點，長毛肯定會對我們的趁火打劫恨之入骨，即便不會停止内戰，沒有參與内戰的下遊長毛軍隊也肯定會和我們死拼到底，我們雖然占據上風，卻未必能夠順風順水的迅速拿下長江沿途諸城，相反還有可能付出慘重代價。”
“其次，我們這個時候出手趁火打劫，還有可能适得其反，導緻楊秀清重新獲得長毛軍心支持。長毛的各大軍頭不是笨蛋，不會不懂一根筷子容易被扳斷的道理，看到我們大兵壓境，隻要稍微有點腦子的長毛軍頭，就一定會選擇聯手抗敵，楊秀清也一定會乘機号召各路長毛齊心協力共抗我軍，借着這個機會重新凝聚人心。”
“第三點最關鍵，我們最危險的敵人并不是長毛，事實上就算長毛沒有内亂，他們也絕不是我們的對手。因爲長毛的内政建設一塌糊塗，既不得士紳學子的人心，又窮兵黩武對百姓苛刻過甚，軍隊和地盤嚴重虛胖，官職繁雜混亂，大小軍頭對楊秀清基本上都是聽宣不聽調，即便沒有吳如孝起兵讨楊這件事，長毛分裂内亂都隻是遲早的事，我們要想消滅長毛，其實随時都可以動手，時時都有機會。”
“我們最危險的敵人是京城亂黨，自明成祖遷都北京到現在，北京城已經做了四百多年的中國首都，那怕是深山裏的鄉民都知道要聽京城裏的話，亂黨現在雖然孱弱，但他們隻要一天還控制着京城，就一天擁有中央大義，軍心和民心都還會下意識的向着他們。”
“京城亂黨還有一個優勢就是政治體制完善，隻要還在手裏的地盤都能夠有效統治，能夠發展生産收到錢糧，源源不絕的獲得軍饷兵員，對軍隊更是如此，此前京城亂黨一道命令就能叫僧格林沁乖乖交出兵權，絕無可能出現長毛軍隊那樣的情況，大小軍頭各自爲戰，表面強大實際上四分五裂，這樣的軍隊雖然相對比較弱小，實際上卻最難對付。”
“最後一點，京城亂黨還有可能繼續獲得洋人的支持和援助，不但羅刹國很有可能還會繼續援助京城亂黨，隻要價碼足夠，英國和法國也未必不會考慮支持他們。而且就算洋人不會直接出兵給京城亂黨幫忙，隻要繼續大量的賣給京城亂黨武器，遷延歲月，給了亂黨大量裝備先進武器和學習先進戰術的時間，也照樣能夠和我們在戰場上一較長短。”
滔滔不竭的說到這，吳超越頓了一頓，先喝了口水潤潤喉嚨，然後才說道：“所以，我們絕不能貪圖眼前之利，趁火打劫先對注定必敗的長毛下手，隻能是把危險扼殺于萌芽之中，優先消滅京城亂黨，至不濟也要拿下京城，獲得中央大義，然後再徐徐消滅長毛也爲時不晚。”
聽了吳超越這番肺腑之言，又深知吳超越一旦下定決心就絕不動搖的狗熊脾氣，在場的吳軍文武重臣也誰都沒有提出反對，全都開口表示支持吳超越的決定。吳超越甚是欣慰，又說道：“好，既然各位都沒什麽意見，那就這麽定了，我們明天就發表公告，宣布對長毛的内戰采取中立立場。”
“且慢！”最得吳超越信任的趙烈文終于開口，反對道：“大帥，你決定繼續先打亂黨我支持，但是我們絕不能發表公告，直接表态中立。”
吳超越和衆人一起疑惑看向趙烈文時，趙烈文這才解釋道：“我們如果直接發表中立公告，那未免太便宜長毛和京城亂黨了。”
“我們如果這麽做了，首先楊秀清那邊可以不必擔心上遊隐患，可以全力對付吳如孝和葉芸來的長毛勤王讨逆軍，壓力大減之下，說不定他就能迅速消滅吳如孝和葉芸來，結束長毛内戰又掉過頭來威脅我們。”
“其次是我們如果發表了中立公告，京城亂黨肯定會明白我們是鐵了心要對他們先下手，也會集中所有力量用來阻擋我們，增加我們的北伐難度。所以直接發表這個代表我們道德信義的中立公告，我們最多隻收到點道義上的美名，實際上卻要吃大虧。”
“但我們如果不急着表明态度，情況就完全不同了。”說到這，趙烈文微微一笑，說道：“第一楊秀清那邊不敢放心背後，已經公開表态支持楊秀清的黃文金也不敢直接東進參戰，長毛那邊的内戰就有可能越打越大，吳如孝和葉芸來也能替我們争取到更多的安心北伐時間。”
“第二嘛，當然是可以麻痹京城亂黨，讓京城亂黨覺得我們随時有可能對長毛下手趁火打劫，爲了促成這點，京城亂黨不但肯定會在談判桌上做出巨大讓步，還有可能疏于戰備，給我們創造出奇制勝的機會。”
還是在聽了趙烈文的分析之後，吳超越才發現自己還是太過講道義了一些，忘了利用自己還算不錯的公信力謀取利益，也馬上點了點頭，說道：“惠甫高見，我們的中立立場是不能立即公布，必須得先把嘴巴閉上，對長毛内戰不做任何表态。”
“也不能完全不說話。”趙烈文微笑說道：“慰亭，我覺得從現在開始，你最好不要再接見楊秀清的使者了，不管楊秀清派來的使者怎麽哀求，你就是不見面不表态，讓楊秀清摸不清楚你的态度立場。”
“但如果吳如孝和葉芸來派人來求見你，你倒是可以公開見上一見，一是讓楊秀清擔擔心，二是給吳如孝和葉芸來一點鼓勵，讓他們可以放心和楊秀清死拼到底。”
吳超越再次認可，又直接問道：“那京城亂黨那邊呢？”
“當然要見。”趙烈文笑着說道：“見面之後，隻談風花雪月，不談軍機大事，不給一句明白話，這樣京城亂黨才會不惜代價的求你出兵讨伐長毛。”
吳超越大笑，當場拍闆采納，然後又接受了趙烈文的建議，決定以防範下遊戰亂危及邊境借口的增兵九江，既向楊秀清施加壓力，又僞裝成随時準備對太平軍下手的假象。
被趙烈文料中，候仁寬趕到湖北請求拜見吳超越遭到斷然拒絕，與吳超越關系不錯的洪仁玕求見吳超越也沒能成功，同時吳超越還沒對太平軍的内戰做任何表态，這些消息傳到了楊秀清的面前後，楊秀清果然打消了調動上遊軍隊東下平叛的念頭，提心吊膽的日夜防範吳超越突然下手，不敢把所有力量投入平叛戰場。
滿清朝廷這邊也是一樣，通過景壽的渠道，得知吳超越對太平軍内戰不做表态，隻是以保護邊境的借口增兵九江，慈安、慈禧和鬼子六果然馬上懷疑吳超越是在準備趁火打劫，也忍不住開始讨論這麽一個問題——用什麽代價，才能換得吳超越全力攻打處于内亂中的太平軍？爲奄奄一息的滿清朝廷争取到苟延殘喘的時間？