很不巧，就在黑田丹波守被斬首後不久。其餘四人中的羽島内藏、西條佐右衛門二人由于在安房國鬼鬼祟祟的行事，被岡本水軍衆在沿海一帶的村莊裏抓獲，并且送至河越城。而另外的仲條右衛門和平塚原次郎二人則是在上總椎津城被闆屋光胤抓獲後不久也送到了河越城。他們四人并沒有見到朝定就被下令斬首，并且他們的首級被送到盡忠寺内築成京觀。
笠原定勝将黑田丹波守斬首的行爲有一點‘殺人滅口’和向朝定獻媚的嫌疑，但是他也是無可奈何的。畢竟麾下的白備之前在河越城下的慘敗直接導緻了一次大換血。緊接着又是和武田軍交戰，他到現在能保住兩千軍勢已是不易。
永祿元年七月二十二日，朝定委托的近衛前嗣請他讓朝廷來介入足利義輝與三好長慶之間的戰事。而近衛前嗣以自己‘禦前首席’和關白的身份，朝廷便中介了足利義輝與三好長慶之間的北白川之戰。三好長慶作爲管領代，理應不能對幕府将軍足利義輝大打出手的。所以，在朝廷的介入下，三好軍撤出京都。與之相對的，三好長慶叙任藤原朝定所卸任的修理大夫一職。
而朝定也不是樂意将自己的擔任了那麽多年的官職就讓出來的。不過，也多虧了讓出修理大夫一職，足利義輝再次進入二條禦所後就派人送來了禦下文。幕府承認藤原朝定在關東有上野、下野、武藏、上總、下總、安房和相模各國讨伐不臣之臣的權利。并且對于之前朝定上書的足利義氏與足利藤氏‘相互勾結，意圖謀逆’的事件也做出了回應——‘廢除關東公方和鐮倉公方，由今川治部大輔氏真爲鐮倉執事。’而後，幕府還送來了委任朝定爲安房、上總、下總、下野四國的守護職。這就讓朝定從今以後有了合法的占有這四國的大旗。
明智光秀也在之後的兩天裏将一千貫永樂錢代替朝定敬獻給朝廷，作爲修繕皇宮的費用。近衛前嗣也随即說服天皇，讓其寫下綸旨，使朝定擁有對北陸、關東、東北各地的逆賊讨伐的權利。而這封綸旨對于足利藤氏、最上義守、伊達晴宗等人就如同‘催命符’一般。他們的好日子很快就要到頭了。
就當柿崎景家、宇佐美定滿等在奧信濃的上杉諸将将要猛攻海津城的同時，位于能登、加賀方面的淨土真宗卻開始行動了起來。
加賀國方面的僧官杉浦玄任四處糾集信徒一萬餘衆，準備向越中進發。而此刻的越中國内隻有唐人親廣等少數親上杉家的國人領主鎮守。就算他們能迅速拼湊出三到四千軍勢，也很難擋住加賀方面的上萬一揆勢。這還沒包括能登的門徒衆。
不過好在軒轅忍者的及時報修，柿崎景家與宇佐美定滿、大熊朝秀等人商議過後就立即将九千越中兵集結并且火速趕回越中。而守備水内、高井兩郡的任務就交給金津義舊、齋藤朝信等人了。小島貞興駐守的落水城是最接近越中的。柿崎景家将快馬派出，讓他先率其部一千軍勢進入越中穩定局勢。
七月二十五日，當河越城内的謙信得知了淨土真宗的起兵後，就隻能先給柿崎景家寫下一封書信。信中特意提到了關于和淨土真宗的一揆勢作戰時“一定要留意門徒衆的大量鐵炮攢射······”。
爲了越中一國不被淨土真宗奪取，柿崎景家與宇佐美定滿、大熊朝秀、土肥政繁等人聯名發布了‘越中總’。要求越中一國内所有的浪人、農兵、足輕、器械、糧草等要在半個月内整合完畢。越中可是越後的屏障，一旦越中全境失守，那麽淨土真宗的勢力就能伺機進入越後，這也是越後諸将所不願意看到的。
一方面，武田信玄将奧信濃的上杉軍越中衆主力用淨土真宗的力量調離。另一方面，他準備着手與織田家談和。由于之前武田家占據了美濃國的加茂郡、可兒郡、土岐郡、惠那郡四郡之地。武田信玄還在東美濃四郡配備了一條信龍、秋山信友等人。不過，擔任議和使者的卻是秋山信友。
秋山信友原爲南信濃伊那衆的旗頭，而後在東美濃的攻略中擊敗了遠山七家（岩村、苗木、明知、明照、串原、飯場、安木）。秋山信友還将已經死亡的岩村城城主遠山景任的正室據爲己有。而遠山景任的正室卻是織田信長的美豔叔母直之方。這樣一來秋山信友就有了足夠的身價去和織田信長談條件了。
作爲遠山七家實力最大的岩村、苗木兩家，他們的選擇卻是不同的。由于苗木城城主遠山直廉娶的是織田信長的親妹妹，所以他就在戰敗之後就帶着家眷逃入織田領内尋求庇護。而岩村遠山的家臣都先後效忠武田家。
武田信玄讓秋山信友去和織田家談和也是看中織田家是松平家的宗主國，隻要穩住了織田家和松平家，那麽武田家再休養一年或者兩年後就能聚集足夠的力量與上杉家決戰，從而一戰定勝負。隻要戰勝了上杉家，武田家就能火速奪取越後、越中、上野等國。他可不想在四面皆敵的情況下與上杉家決戰。
雖然武田信玄的如意算盤打得不錯，可是他忘了最重要的一點——上杉家的動員能力。
一旦武田信玄把謙信和朝定逼急了，那麽一紙總下來，那麽其總兵力就是武田家的數倍。盡管武田家甲斐、駿河、伊豆、遠江大部和信濃大部，可是遠江、駿河兩國的根基完全不穩。隻要朝定派一支數量不少的軍勢開入駿河，那麽大量的地頭武士就會紛紛倒戈。
相比較武田信玄一個接着一個的把戲，朝定并沒有用太多的精力去關心，他倒是做出了一個非常驚人的舉動——令小山秀綱收真田昌幸爲養子，并且讓出家督之位。
至于朝定爲何會讓真田昌幸這個出自滋野一族的人去繼承出自藤原北家秀鄉流的小山家。其原因就在于上杉家才占據下野國全境不久，最重要的就是迅速消化和安定。加上真田昌幸在朝定身邊待得時間也不短了，是時候讓他去試試手當領主了。
下野國也不是特别的兇險，北面的那須郡有明智衆、西面的足利郡和梁田郡有秋山定綱、南面還是和下總國接壤。而小山家内部也隻有小山高朝這個早就退隐的家督感到不滿而已。至于小山秀綱和富岡秀高兄弟二人也已經見識到了上杉家能用武力削平割據的國人衆勢力的能力。他們也不會傻到爲了自己家族的榮耀和關東公方奉公衆的身份去和上杉家剛正面。
七月二十九日，真田昌幸奉朝定的命令離開了河越城而來到了小山家的本據袛園城外。他這一來，小山家上上下下都惶恐萬分，生怕怠慢了什麽。除了小山高朝沒來迎接真田昌幸，其餘的小山家衆人能數得上名的全來了。這些迎接的人裏包括現任小山家家督小山秀綱、一門衆筆頭榎本高綱（小山秀綱的叔父）、富田城城主富岡秀高、富岡秀長（富岡秀高之子）、重臣荒川秀景等。他們是非常熱烈的歡迎真田昌幸的到來，至少他們能在故鄉繼續生活了，而不用被改易。這樣的處分對于小山家來說還是可以接受的，畢竟領地一寸未少。