于是，劉雲四人便關起門來“苦練内功”，其中首要的是設計一款專爲星際戰鬥打造的戰列艦。之前的空天艦隊效率不高，因爲無人炮艇太小太脆弱，戰鬥力又差，數量也形不成優勢，而戰鬥主要就靠母艦。但母艦還要承擔許多别的任務，例如生産裝備、攜帶物資、建造殖民地等等，對戰鬥力造成很大的影響，效率體現不出來。那麽，新設計的戰列艦就必須專門爲戰鬥而生。
而當前科技水平下，星際戰鬥的主要武器就是激光炮加導彈，那麽就必須加強這兩方面的設計。母艦上沒有這麽多空間搭載更強大的激光炮，那麽戰列艦就必須做到這一點。
至于導彈方面，小型導彈對動辄億噸的星際戰艦而言傷害力太小，那就必須造得更大，導彈本身也有裝甲，防止被敵人的攻擊型護盾摧毀，速度方面2400公裏每秒已經差不多了，最關鍵要提高射程。在太空中，雙方距離動辄數百萬公裏，就算光線傳播也要幾十秒，這時候若要實現實時制導，實現更高精确度，更強的靈活性，就必須采用空間波技術——空間波雷達制導。因爲母艦的蟲洞引擎已經用到空間波搜索的功能，也有了空間波雷達，那就必須把它用到導彈技術中去。空間波能夠探測一個區域内的引力波動，由此識别目标，有了空間波雷達，那麽相關制導技術的誕生隻是時間問題。
于是，劉雲四人經過多次設計、試制，終于在鄰近2050年底之時把新型戰列艦設計出來，然後便開始投入生産。
這種新型星際戰列艦，重新拾回“鳳凰”的名字，叫做“鳳凰戰列艦”！鳳凰者，鳳舞九天，而且是不死鳥，千年一涅槃，劉雲希望自己的戰列艦能夠像鳳凰一樣，在星空中發揮強大的戰鬥力，而且“打不死”，甚至“死而複生”。“死而複生”這一點不是吹牛，而是有技術支持的，這次的設計，能讓鳳凰戰列艦被摧毀之後的殘骸能夠在回收後快速修複，這也勉強算是“死而複生”了吧。另外，對于艦内人員的緊急逃生，劉雲也想出一個絕妙的法子，容後再提。
鳳凰戰列艦，滿載重量約80億噸，長4200米，最大寬度爲960米，最大高度爲660米，整艘船呈平底梭形，艦首較爲平滑，并非尖梭形。實際上，如果拿鳳凰戰列艦和舊的鲲鵬母艦相比，那麽鳳凰戰列艦的個頭小得多，而平均密度也大得多，這是因爲鳳凰艦上采用精金、秘銀複合裝甲的比例大爲提高了，這密度自然就上去了。實際上，鳳凰戰列艦的防禦力甚至比3倍重量的鲲鵬母艦還要高！這就類似以前的航母，雖然噸位大，但防禦力卻不及噸位稍小的戰列艦，因爲裝甲厚度有很大差别。
考慮到星際戰鬥中戰列艦将面對大量的激光攻擊，所以外殼需要更高的反射率，以提高對激光的抗性。秘銀的反射率是挺高的，但那隻是對可見光，對X激光的反射率還顯得不足，爲此，劉雲将誇克機器人中的轉換核摻雜進秘銀中去，這種方法類似半導體工藝，通過摻雜來控制材料的性質。摻雜之後，秘銀的深層電子形成的能帶更寬，對超強X波段激光的反射率大大提高了。實際上，光是反射率的提高用處并不大，因爲激光強度如果超過反射材料的上限，那麽一切都是徒勞的，隻有把反射上限提高才真正有用。而摻雜之後的秘銀，最大的增強正是反射上限！經過測試，劉雲發現新型反射裝甲能将思金戰列艦主炮級别的激光的損害降低30%！這就相當于對激光的防禦力提高了42%，效果非常明顯！
至于導彈爆炸的高溫和震爆攻擊，精金、秘銀複合裝甲的抗性一向很強，是思金母艦材料的五倍左右，這項優勢本身就很明顯，暫時不用加強了。
在海戰時代，無畏艦開啓了“大炮巨艦時代”，實際上無畏艦屬于“全重型火力戰列艦”，全重型火力意味着對敵艦的傷害力提高到一個新的高度，這就是最大的革新。而現在，劉雲設計的星際戰列艦，就不能再裝備那種小型的隻能打飛機的激光防禦炮了，必須采用“全重型激光炮”的配置，才能适應新的星際戰鬥。
鳳凰戰列艦，艦首擁有四門口徑200米的巨型激光炮，四門主炮呈菱形排列，炮口與艦首齊平，并不突出來影響性能與外觀，由于采用相位控制技術，因此炮口無需旋轉也能控制激光方向。這四門主炮，每一門持續發射的激光能量可達到2000萬噸**每秒，看起來比鲲鵬母艦的激光炮弱了一半，但實際上因爲口徑減小，實際能量密度還提高了一倍。當然，一艘鳳凰戰列艦的主炮火力總和仍不如舊的鲲鵬母艦，但戰列艦的噸位隻有鲲鵬的三分之一，而且，這些新型的激光主炮多了一個“蓄能”的功能，這在戰鬥中非常有用。新型激光主炮，蓄能時間可達60秒鍾，也就是說可以将一分鍾内蓄積的能量瞬間爆發出去，威力十分可怕！如果用激光持續攻擊敵人，那麽敵人可以調整姿态閃避攻擊，讓攻擊效率降低。如果距離遠，激光有延遲，那麽發射的能量真正起作用的可能還不到十分之一。而如果把能量累積到一個脈沖之内，如果擊中的話，就能一擊重創對手！
當然，要真正重創對手，還需要命中才行，所以，這鳳凰戰列艦，十分講究“首發命中”，對人員素質要求很高。鳳凰戰列艦編隊加入戰鬥前，通常都蓄滿能量，進入戰鬥後瞅準時機發射，如果擊中敵人，那麽可能第一發攻擊就将敵人的整個艦隊打掉一小半，對戰局十分有利，如果沒命中的話，之後的戰鬥就困難許多了。戰鬥過程中通常需要保持火力輸出，敵人可不會靜靜地等你蓄滿一分鍾後再釋放，所以一般隻有開始時可以使用蓄能。
除此之外，鳳凰戰列艦還擁有160門激光副炮，分布在各個位置，這些激光副炮的能量也達到30萬噸**每秒，一般作爲防禦用，如果面對敵方大批小型艦船，這些副炮就能造成大片的殺傷。總之，再也不會出現那種導彈飛來，激光能量太弱，竟然攔截不掉的尴尬局面。
不過，戰列艦不是專門反導用的，如果要反導，應該主要靠護衛艦。
除了激光主炮，鳳凰戰列艦還裝備了新的星際導彈——“巨阙”導彈。上次和思金人，嗯，準确地說是和玩家天邪打了一仗，劉雲發現他的星際導彈都是千噸級别的，因此，劉雲也把巨阙導彈造得相當巨大，重達5000噸。爲了不讓它輕易被敵人攔截，劉雲還特地爲導彈設計了秘銀裝甲。導彈的秘銀裝甲是可選的，一般可以隻用普通穿甲彈頭，但若對方反導能力強，便要使用秘銀裝甲的巨阙導彈。巨阙導彈身長達到40米之巨，直徑6米，而有五千噸的體重，這平均密度相當高，原因是裝甲較重，适合作爲穿甲彈。
射程方面也必須提高，至少要達到1000萬公裏，因爲思金人的“飛彈蟲”就有如此射程，不能吃射程的虧。在這麽遠的距離上，是需要空間波雷達制導的，否則命中率就會大爲下降。
像“巨阙”這樣的巨型導彈，隻有大型戰艦能夠搭載并且發射，而鳳凰戰列艦就是極好的搭載平台。
實際上，如果鳳凰戰列艦隻是裝甲強大，攻擊力強大，僅僅如此而已的話，還稱不上“不死鳥”，要實現這個功能，就要做好人員逃命的措施。爲此，劉雲設計了一種微型蟲洞，一端設在鳳凰戰列艦上，另一端則在母艦之上，一旦鳳凰戰列艦損毀嚴重，即将被擊毀，那麽艦上人員可以通過微型蟲洞迅速轉移到母艦之上。微型蟲洞并不出奇，都是沖動，但這種微型蟲洞的兩個端口都可以跟随各自所在的艦隻任意移動，就像綁定了一樣。于是，這種微型蟲洞就相當于“任意門”了。要使戰列艦上大批人員迅速逃生，就不能隻有一個任意門，必須每個艙室都擁有，至少重要的艙室都擁有任意門，以便讓所有人都能安全撤離。
而人員撤離之後，鳳凰戰列艦如果被擊毀，變成殘骸，那麽就會啓動戰列艦内剩餘的誇克機器人，開始緩慢修複。如果能把殘骸拖到一種移動戰艦維修廠——船塢母艦之中，就能迅速修複，并且重新投入戰場使用，相當于鳳凰涅槃了一次。如果敵人強到秒殺鳳凰戰列艦，那還是算了吧，這樣的敵人是暫時惹不起的。
制造出鳳凰戰列艦之後，劉雲立馬安排一批鲲鵬母艦的武器操作手進行集訓，重點訓練他們的“首發命中”能力，這對新的鳳凰戰列艦十分重要。
除了戰列艦，母艦的設計方案也要進行大規模改造，舊的鲲鵬母艦配置不合理，要被抛棄了，劉雲重新設計了母艦，不再使用“鲲鵬”的名字，改稱爲“神龍母艦”。神龍母艦與鳳凰戰列艦，正好可以搭配。于是，這種命名方式被劉雲一直沿用下去，現在生産的神龍母艦可以稱爲一代神龍，對應一級母艦，之後的則爲二代、三代，等等。
對母艦的改造，首先要确定其功能，讓其更加專業化。劉雲設計了兩種母艦——指揮母艦和船塢母艦，前者是戰場上的指揮核心，至于後者，則能夠直接生産戰列艦這樣的大型戰艦！
一般來說，戰列艦和母艦都非常龐大，都必須在專門的星際船廠中生産，這種船廠占地面積極廣，而母艦一般隻能生産護衛艦之類的小型艦隻，最多能生産稍大的驅逐艦，戰列艦是沒法生産的。而劉雲他們的技術比較獨特，可以直接使用息壤核心生産，所占的地方不大。那麽，船塢母艦基本上是一個巨大的空殼子，裏面裝滿生産材料，還有一個巨型息壤核心，一次隻能生産一艘戰列艦，這已經是極限了。
至于指揮母艦，則在原有鲲鵬母艦的基礎上進行改進，去掉激光主炮，隻安裝一些防禦用的激光副炮。至于離子炮則保留了，雖然敵人基本都有磁場護盾，但有時候離子炮能發揮意想不到的作用，就像上次劉雲用離子炮來清除妄圖奪艦的思金人，以及用來清除前路的障礙。戰列艦上是沒有離子炮的，那會降低武器效率，所以隻能讓指揮母艦裝備離子炮。
指揮的功能并不需要占用多少空間，那麽，指揮母艦中的許多空間就可以用來生産護衛艦等消耗型小艦艇，以及裝運登陸艦、陸戰隊，這是占領敵方行星必備的兵種。
而護衛艦，作爲整支艦隊的防衛力量，也需要用心去設計，因爲星際導彈是重大威脅，如果護衛艦隊做得好，那就可以攔截掉大部分的導彈，大大提高艦隊的生存能力。
設計了鳳凰戰列艦之後，劉雲他們再接再厲，設計了一種1000萬噸級的護衛艦，名爲“羽林”護衛艦。羽林護衛艦呈長梭形，身長600米，最大寬度80米，而最大高度爲60米。與一般的戰艦不同，羽林護衛艦不裝備主戰武器，因爲它的任務不是戰鬥，而是防衛，因此，其上裝備的防衛武器的數量極多！
首先，護衛艦上裝備了衆多的反導激光副炮，這種副炮的口徑達到30米，出射能量爲30萬噸**每秒，與鳳凰戰列艦上的副炮規格一樣。說實話，戰列艦的副炮裝在護衛艦上，也相當于主炮了。因此，這種激光炮的數量不可能多，一艘羽林護衛艦上僅有16門，四門爲一組，分布在護衛艦的前、中前、中後和後部的上表面。這種反導激光炮用來防禦5000噸級的星際導彈簡直是輕而易舉！但其缺點是數量太少，一艘護衛艦僅有16門。不過一艘母艦所攜帶的護衛艦可以達到四百艘，加起來這樣的反導火力也相當驚人了。
其次，護衛艦上海擁有“電磁近防炮”。電磁武器已經不新鮮了，現在的中國軍隊中到處都是電磁軌道炮，在地球上的射程能達到兩千公裏，在近地軌道中則能打到大半個地球，但是，其初速度大多在一萬米每秒左右，這種速度在地球上是飛快了，但在宇宙中則是慢如蝸牛，有什麽用呢？如果要讓電磁近防炮達到能夠防禦星際導彈的效果，那麽出射速度應該達到數百到一千多公裏每秒才行！但是，電磁炮的加速軌道的長度有限，以普通超導磁體的磁感應強度，是沒法加速到這麽快的，那麽，這就需要全新的超導體。
很幸運，劉雲他們在豐富的異形核材料家族中發現了一種新型超導體——磁曜石。這種磁曜石是常溫超導體，其轉變溫度在500度左右，并不算耐熱超導體，但其臨界磁場和臨界電流特别高！因此，磁曜石能用于制作超強磁力線圈，用在電磁近防炮上沒有任何問題。不過，磁曜石也有缺點，它是晶體，隻有晶體狀的磁曜石超導性能最好，粉末狀的就差很多了，而性質比較硬脆，沒有延展性，沒法像金屬那樣可以随意拉長制成導線，那麽，如果要用磁曜石做成線圈，就必須在生長的過程中一次成型！用普通的生長材料的方法是很難做到這一點的，線圈的幾何空間結構很複雜，難以在生長過程中就長成這樣，但是，若用納米機器人和誇克機器人來生産，這個問題就輕易地解決了，因爲這些微型機器人制造所有東西都是一次成型的，而且缺陷幾乎沒有，可以輕易制造出完美的晶體。隻需在納米核心工廠中将電磁近防炮一次成型，或者直接讓息壤核心制造整艘“羽林”護衛艦，這些問題都能一次解決！
最後定型的電磁近防炮采用多管火炮的模式，單管口徑400毫米，标準電磁彈丸每枚重1.5噸，屬于穿甲彈類型。羽林護衛艦的電磁近防炮是36管一組，排列方式爲中間一圈6管，排成六邊形，六邊形的外側密排12管，同樣也排成六邊形，最外邊的18管也密排在其上，總共36管（可以用硬币驗證這種排列方式）。電磁近防炮出射速度達到1000公裏每秒！而每一管的射速達到20發/秒，如果一組近防炮全速開火，那麽每秒打出720發炮彈，重達1080噸！這樣開火，物質消耗速度是很快的，但卻能在太空中織起一道道強大的近防火力網，就像加特林機槍一樣，用密集火力來攔截敵方導彈。
每一組電磁近防炮的總半徑達到7米，在護衛艦的上表面上占用空間不大，因此一艘羽林護衛艦裝了80組電磁近防炮，分爲5個防禦區塊，間隔在激光副炮陣列之間。不過，電磁近防炮開火的時候可要注意了，火力一旦全速開動起來，那彈藥流失速率是極高的，一不小心彈藥庫就打光了！而且，不能所有電磁近防炮同時開火，那後坐力非常大，會引發不可預知的後果！
注意到，羽林護衛艦的所有防衛武器都安裝在上表面，下表面則沒有，這是因爲護衛艦一般都在戰列艦和母艦周圍執行防禦任務，隻需防衛一側就可以了，兩側都有武器就沒有必要。