因爲山東軍區雖然失利，但并未潰敗，兵力損失并不算大，而且由于是主動進攻一方，自已的領土也并沒被清軍占領，相反還有所擴大。而且清軍在山東的兵力也被進一步削弱，因此在中華軍撤退之後，也無力發動反擊，可以說山東的局勢和戰前相比，并沒有發生什麽改變，甚緻中華軍還要略好一點，隻要是總結好這一戰的的經驗教訓，還可以再向山東發動進攻。
另外就在山東戰役發生的這一個月的時間裏,北方的局勢，也發生了有利于南京政府的極大變化。
原來在北方各地的農民起義，原明官員反正爆發的十分頻繁。
首光是在山東地區，繼謝遷起義之後，在山東西南部與河北大名府交界一帶的曹州、濮州、範縣等地區也爆發了以任七、張七爲首的農民起義，同時清廷的曹州守将，也是原明總兵劉澤清的舊部，李化鲸、鄭隆芳、姚文昌等人也響影起義軍，以曹州爲駐點，起兵反正,舉起了反清的大旗。
而在陝西神木縣，也發生了高友才爲首的農民起義，起義軍聲勢大振，在很短的時間裏,就連續攻取了陝北地區的十九個州縣，并委任了巡撫以下的各級文武官員。同時原明将領，出任清廷的延安營參将王永強，也借着帶兵赴神木、府谷等處平亂之機，起兵反正響應，占領了陝北的重鎮榆林，殺死了清廷的延綏巡撫王正志、延綏總兵沈文華、靖遠道夏時芳等官員，并自稱招撫大将軍.随後王永強又引兵南下，會同留守延安的原明将王永鎮，占領了延安，殺死清廷的延安知府宋從心,以廷安、榆林兩地爲基礎，與高友才的義軍互相呼應。
與此同時，甘肅回族将領米喇印、丁國棟、黑承印等人也在甘肅地區發動了反清起義，連克甘州、涼州、肅州等地，清廷的甘肅巡撫張文衡、甘肅總兵劉良臣、肅州副總兵潘雲騰、涼州副總兵毛镔、甘涼道林維造、西甯道張鵬翼等地方官員都被擒殺。接着米喇印、丁國棟等人引兵東進，攻破蘭州，殺同知趙沖學、知縣趙翀；連克臨洮、河州、洮州、岷州等地。這一次起義，參與的不僅有漢族百姓，也有大量的回族百姓，也反映了甘肅等地區的回民對清廷的暴虐統治嚴重不滿。
不過在北方各地的反正起義中，反清聲勢最爲浩大，範圍最廣，同時也是對時局影響最大，還數在山西發生的原明将領，清廷的大同總兵姜瓖起兵反清。
姜瓖是陝西延川縣人，原來是明朝挂鎮朔将軍印大同總兵。在崇祯十七年（1644年）三月，大順軍攻克太原後，姜瓖投降了大順軍，李自成仍然讓他鎮守大同。同年五月，大順軍在山海關戰敗之後、姜瓖又發動叛亂，殺害大順軍守将張天琳，歸附了清朝。姜瓖降清之後，仍然還是繼續充當大同總兵，并且曾随英親王阿濟格西征，在鎮壓陝北大順軍高一功等部時，表現頗爲賣力。
不過在姜瓖降清之前，因爲并不了解清廷有入主中原的意圖，因此在大同擁立了一個名叫朱鼎珊的明朝宗室爲王，以号招人心，而這一事件也使清廷對姜瓖始終難以放心，對他多方質疑，并且還命姜瓖将長子送到北京入朝侍衛，實際就是充當人質。
姜瓖自以爲不費清朝一兵一卒，把大同地區拱手獻給了清廷，接着又在陝西榆林擊敗大順軍，不僅功高無賞，反而備受猜疑，因此也憋了一肚子怨氣。
在北京暴亂發生之後，清廷雖然最終決定對百姓以安撫爲主，但對手握軍權的漢族将領猜忌益深，而大同地區的清朝官員又奉命征集糧草，急如星火，使百姓怨聲載道，對姜瓖也多有指質其征催錢糧不力，懷有異心等等。
而就在這時，中華軍的水軍襲擊大沽口，山東地區又發動對清的進攻，姜瓖本來就對清廷十分不滿，這時也覺得機會來了，于是乘宣大總督耿焞等人出城驗草的機會，突然關閉城門，下令易冠服，并自稱大将軍，公開揭起了反清的旗幟。
姜瓖在大同舉義反正之後，山西各地的漢族官紳紛紛響應，原明大學士山西曲沃人李建泰，原明甯夏巡撫李虞夔等人也都在家鄉積極策動鄉紳共襄義舉反正。
另外還有原明将領劉遷、萬練等人也起兵響應，速度占領了甯武、岢岚、保德州、代州、繁峙、五台等州縣之地。在山西東南，有胡國鼎、陳杜、張鬥光等人起響應，攻克澤州、平順等地。而在山西西南，蒲州到陝西韓城一帶，也有虞胤、韓昭宣、李企晟等聞風響應，克陷蒲州及蒲屬臨晉等縣。
結果在在很短的時間裏，山西全省除了省首府太原和少數城池外，差不多都被反正的義軍占領，同時姜瓖還派人潛入南方，和商毅聯絡，希望能夠得到商毅的影響和支持。
在這一糸列的起義反正中，最大的特點是，并不是像一般的農民起義一樣，隻有農民參與，或是以農民爲主體。而且在農民起義爆發之後，很快就有大量的原明官員和将領廣泛的參與其中，由于他們都居有相當的軍政經驗和能力，因此在短時間內，也将起義反正的聲勢造得非常大。
另外這一糸列的起義反正表面上看來，還是北京爆亂的餘波，但從根本上來說，是北方的漢族人對清廷統制不滿的一次集體大爆發。
本來在明朝滅亡之後，由于大順政權的施政不當，對占領地區的官紳地主實行的追贓助饷政策，黃河流域一帶的漢族官紳一度受到大順政權的沉重打擊。因此在清廷入關，擊敗了大順軍之後，也公開表示，維護當地官紳的既得利益，北方的許多地區的官紳地主，也把清廷看成維護自身利益的新靠山。同時清廷打出的“代明剿賊”，“吊民伐罪”等旗号，也起到了一些收壟人心的效果。
因此在清廷剛建立時，在北方反抗清廷的基本是以農民起義爲主，而漢族官紳基本都選擇投靠清廷，并且積極幫助清廷攻擊大順軍，以及鎮壓反抗清廷統治的農民起義。在這樣的情況下，清廷才能夠迅速的平定北方，連續擊敗大順軍，并逼迫大順軍南下。
如果清廷在這個時候能夠抓住這一時機，穩定人心，完全可以使自己在北方的統治穩定下來，就算南征失利，也可以立足北方，形成南北對持的局面，但可惜随着清廷在北方統治穩定之後，錯誤的推行了一糸列的錯誤政策，如剃發令，圈地令，逃人法，投充法等，而在政治上又推行民族歧視政策，重滿輕漢，而在漢人之中，又重遼人而輕新附漢人。使北方官紳地主的尊嚴和利益都受到不同程度的損害。因此他們在政治态度上随之發生分化。
盡管還是一部分官紳忍氣吞聲的乞憐于清廷；但有相當一部分官紳在由依附清廷轉變爲公開、秘密反清活動，或者是反清的想法，包括有許多一開始公開投降清廷的原明官員。而在這時，南京政權也随之成立，也成爲不少北方的漢族官紳的希望。
北京爆亂的發生隻是第一根導火索，使許多在清廷并不得意的原明官員、武将，也都認爲清廷實力有限，自己大可一試身手。也不少人由此而開始有了起事反正想法；而中華軍攻破大沽口是第二根導火索，讓人們見識到中華軍完全有能力向清廷發動進攻；而中華軍在山東發動對清廷的進攻以後，也讓北方的漢人明白，中華軍準備大舉北伐了，因此反正舉事起義的爆發也成爲推倒的多米若骨牌，一爆而不可收拾。
當然從地理位置來看，山西緊靠京師，因此姜瓖在大同舉義反正，對清廷的威脅極大。毅雖然知道，姜瓖本身不過是一個反複無常之輩，這次舉兵反正，也并不是出于什麽民族大義，純粹是出于對清廷的崇滿歧漢政策不滿，自己在清廷不受重用，再加上現在南北局勢己經發生了很大的變化，清廷的統治并不那麽穩定，因此才起兵反正，在這亂世中再投機一把。
但無論姜瓖舉義反正的動機會如何，在客觀上是有利用中華軍對清廷的進攻，因此商毅和南京政府内閣、**部經過商議之後也決定，向清廷發動全面進攻，于是**部也正式下令，湖廣軍區的司令部，立刻出兵進取南陽，進而收取洛陽；淮南軍區也馬上出兵，向宿州、毫州一線平推，然後進取徐州；而南京軍區做爲預備兵力。
而山東軍區，仍然繼續岀兵，進取兖州、濟南，配合另外兩路的進攻。同時商毅又下令，讓駐守海州的鄭成功部，率軍進入山東，增加山東戰區的兵力，協助山東軍區作戰。