得知這時大西軍人馬雖多，但的幾員主将孫可望、劉文秀、艾能奇、馮雙禮等人這時都不在張獻忠的身邊，吳三桂認爲應該抓住戰機，立刻出擊，但尼甚對此卻半信疑，又擔心大西軍人馬衆多，因此也舉棋不定。
吳三桂見狀，決定獨自出擊，在順治三年（1646年）十一月二十六日，下令以劉進忠爲向導，部将高大節率領精銳騎軍，輕裝疾進，出其不意，對大西軍發起突然襲擊。
二十七日清晨，清軍隔太陽溪與張獻忠的大西軍相遇。面對這意外的突然來襲，張獻忠率軍創促應戰，指揮大西軍馬步兵迎戰清軍。
中午十二時左右，吳三桂率大軍趕到戰場，遣部将胡國柱向大西軍右翼進攻，郭壯圖攻擊大西軍左翼。自己親率人馬，中路進攻，戰鬥打得非常激烈，一直打到黃昏時分，大西軍終于抵擋不住，全線潰敗。
就在這時，張獻忠帶着十幾名衛士在太陽溪邊督戰，劉進忠爲吳三桂指點道：“這就是八大王。”吳三桂立刻下令，向張獻忠齊發亂箭，在混亂之中，張獻忠中箭身亡，清軍大獲全勝。而這時馬寶、夏國相也攻克了成都。
在張獻忠死後，部将孫可望、劉文秀、艾能奇、馮雙禮等不敢再向陝西進軍，衆人合兵之後，決定以孫可望爲首，率軍向南，在重慶府境内，受到明降将曾英部的阻擊，經過了一番激戰，孫可望等人軍擊敗了淸軍，并臨陣斬殺了曾英。這時孫可望本打算繼續率軍進攻，奪取重慶做爲川中的立足之地，但這時吳三桂己命大将高大節、王屏藩率軍來增援重慶，因此孫可望等人也不敢在重慶停留，率軍南下，向貴州方向轉移，後來退進了雲南。
而吳三桂本來就打算在四川占地割據，在占領了成都和重慶這兩個四川最重要的城市之後，也忙于穩固占領地區，設将守衛，招降大西軍的餘部，因此也沒有去追趕孫可望等人。
這時張獻忠的勢力基本全部都退出了四川省，而吳三桂搶占了成都、重慶、潼川、夔州等川中地區，而尼堪率領的清軍占領了川北地區，而在川南地區，還有不少明朝的殘餘勢力。而四川的戰事也暫時告一段落。吳三桂和尼堪各守各自的占領區，暫時也都相安無事，并向北京的清廷報告了四川的戰事經過。
玄皇教過去在四川也進行過布置，雖然沒有南方這麽深厚，但也有一定的基礎，打聽一些基本的消息和動向，還是做得到的，現在經過了明石姬的改造之後，也都成爲商毅現在的情報網絡，不也四川和浙江兩地，一個長江頭，一個長江尾，相隔萬裏，其間又有千山萬水，因此從四川把消息傳回來，至少也要一個月以上的時間。去年十一月就發生的事情，一直到今年開年之後，商毅才收到。不過這也是沒有辦法的事情，離着這麽遠，就是用信鴿也不好使。
從時間上看,大西軍在四川敗亡的時間和另一時空差不多,不過清軍占領四川的時間提前了，而且吳三桂居然真的挪到四川去了。可以說現在的局勢也變得越來越複雜，當然也越有趣了。
不過四川土地肥沃、資源豐富，素有“天府之國”之稱，在中國版圖中的地位雖然十分重要，但由于地理位置過于偏避，交通也不便利，始終起不到決定性的作用，也有“天下未亂而川先亂，天下未定而川先定”之話。因此吳三桂雖然占領了四川，但恐怕也難成大器。當然也不能對他掉以輕心，因爲如果四川和清廷攜起手來，對自己來說還是相當不利的。
商毅想了一想，對明石姬道：“我們在四川的情報人員有多少？都是以什麽身份隐藏？”
明石姬道：“一共有三十八個人，現在都是當地居民，身份基本都是地方的幫會。”
商毅點了點頭，道：“人數到是不少，但身份太單一了，安排一批人轉換其他身份，現在清軍剛進四川，百廢待新，而且吳三桂一定會在川中擴軍，找幾個合适的人，争取打入到軍中去，還安排幾個人經商，這樣也容易和我們聯絡互通，另外再安排一批新人過去。不過讓他們暫時不要輕舉妄動，先把根基紮牢再說。”
明石姬也點了點頭，道：“還是相公想得周全，妾身實在是自愧不如。”
商毅微微一笑，道：“少給我帶高帽子了，情報工作不是能一蹴而就的事情，凡事要一步一步的來，而且沒有你們以前在四川的基礎，現在恐怕還是舉步維艱。因此這一切也都是你的功勞。”
聽到商毅的誇贊，明石姬也不禁心中竅喜，低下頭道：“妾身整個人都是相公的，何況是爲相公做這些事情。”
商毅又笑了一笑，把她拉到自己懷裏，在她臉上親了一下，道：“剛才我答應鳳舞，今晚陪她，明天到你房裏休息，好嗎？”
明石姬嫣然一笑，雙手勾住商毅的脖子，道：“明天妾身一定洗得香噴噴的，迎候大人。”然後也在商毅的臉上親了一下，這才起身飄然而去。
等她走了以後,商毅也不禁苦笑了一聲,看來老婆多了,也不一定就是好事,每個人都需要安撫，那些穿越的前輩們的老婆都是兩位數以上起步,是怎麽過來的呢。
就在第二天，從北京也傳來了消息，清廷作出幾項重大的人事變更，首先是攝政王多爾衮病重不能理事，由禮親王代善出面，代行攝政事務；洪承疇因爲江南督師不力，敗軍辱國，但估念其對大清一片忠心，平時素有功勞，因此令其戴罪立功，出任屯田大使，責任陝北、甘肅等地的軍屯事務。而鄭親王濟尓哈朗從遼東調回北京，奉命南下總督湖廣、河南、山東軍務。
付責屯田工任，其實是一個苦差事，由其是陝北、甘肅都是屢遭戰亂的地區，不少地方的田園荒蕪都在十幾年以上，沒有十年的功夫，很難見到大成效，因此讓洪承疇幹這個差事，也可以看作是對他變相的一種懲罰，當然讓洪承疇出任屯田大使，實際是一個幌子，其由是付責軍屯，其實就是讓洪承疇借機訓練新軍，否則在朝廷裏交待不過去。
不過雖然洪承疇爲多爾衮承擔了敗軍的責任，但畢竟現在多爾衮才是清廷話事人，而且這一次南征也是多爾衮一力主張策劃的，因此南征失利之後，也連帶多爾衮的聲望大跌，滿州貴族中有不少人對他都頗多微詞，同時多铎戰死，也是多爾衮陣營的一個重大損失，一些過去受多爾衮壓制的勢力也都看到了機會，開始蠢蠢欲動，企圖把多爾衮扳倒，取而代之。
鄭親王濟爾哈朗也就是其中之一，雖然這時濟爾哈朗人在遼東平亂，但也遙遙指揮着一些黨羽，在北京上下活動，不斷拉隴其他反對多爾衮的勢力，借這次戰敗之機，打擊多爾衮，爲濟爾哈朗造勢。而且濟爾哈朗本身，也還有一定的實力，因此其他一些人也都附庸在濟爾哈朗周圍，搖旗納喊，爲他助威造勢。
但多爾衮畢竟是掌權多年，勢力根深蒂固，雖然元氣大傷，但仍然不可輕動，而且兩宮皇太後也十分清楚，現在清廷還需要多爾衮坐鎮，因此雙方又結成了暫時的同盟。
不過現在濟爾哈朗的攻勢咄咄逼人，多爾衮暫時還不能與其正面交鋒，因此也想出了一個以退爲進的辦法，以病重不能理事爲由，趁着濟爾洽朗在遼東平亂，把一向不管事的代善推到前台來當幌子，而多爾衮退到背後來操縱一切。以代善在清廷的資曆,由他接替多爾衮代理攝政事宜,誰也說不出反對的意件來。而且代善年事己高，本來就不大理事，朝野上下又盡是多爾衮的黨羽，又有兩宮皇太後的支持，也不怕代善會趁機奪權。
代善推辭不過，隻好答應出頭來代理攝政事宜，不過他也十分清楚自己的位置，因此但一切行政事務，實際通過何會洛，都是按多爾衮的意圖來辦。結果多爾衮不僅避開了現在的衆夫所指，而且也斷絕了濟爾哈朗的執政希望，還能夠繼續把持着朝中的大權，實在是一石三鳥。濟爾哈朗的攻勢雖然看似兇猛，卻是一拳打在棉花上，渾不受力。
而多爾衮在化解了濟爾哈朗的進攻之後，也立刻展開反擊，因爲按洪承疇所說，既然湖北、淮南之地很難保全，那麽這個敗仗就讓濟爾哈朗去吃好了。因此多爾衮就把濟爾哈朗調到南方去總督湖廣、河南、山東軍務。
一但等到濟爾哈朗丢失了湖北、淮南之地以後，恐怕也沒有資格再鬧騰下去了，而到了那時，多爾衮也就可以宣布病愈複出，重新走到前台來。