雖然吳甡比商毅動身的時間早了大半個月，但北京離廬州更遠一些，而且中原地區以被李自成所占，還必須繞着道走，再加上吳甡又是刻意放慢了行軍的速度，因此隻比商毅提前了七天到達廬州。
之所以把這次吳甡南下督師的地點放在廬州，是因爲長江中遊的地區被農民軍占領，特别是武昌失守，導緻南京吃緊。崇祯最擔心的就是農民會順江而下，一舉攻克南京，席卷江南諸地。南京不僅是明朝的第二首都，同時也是整個江南地區的屏障，而現在明朝的财政收入有七成來自于江南地區，因此南京一但失守，不僅僅意味第二首都失守，而且等于是徹底切斷了明朝的财政收入來源。
在這種情況下，吳甡南下督師的首要目地，就是先要保住南京不失。然後再能再談其他的事情。而廬州就是南京的門戶，左良玉己駐軍在九江，吳甡再守住廬州，基本就可以保證南京的安全了。
不過吳甡在南下的過程中，雖然走得不快，但他也不是一點事情都沒有做，而且在沿路上盡力招集地方軍馬，擴大自己的隊伍，使人馬達到了五萬餘人。同時又下令駐守在安慶府的劉良佐和黃得功部也得自己靠隴，分别駐守六安州和廬江，保護廬州府西南入口。而且這樣一來，加上劉良佐和黃得功部至少在名議上，吳甡手裏以經擁有了近十萬的大軍。
同時吳甡也深知手裏隻有人馬還不行，因爲人要吃，馬要喂，還要有銀子才能使士兵賣力作戰，沒糧沒錢,就什麽事也辦不了.因此又讓南京的兵部尚書史可法，籌備糧草軍資，運抵廬州以供軍用，以便人馬到了廬州之後，至少在後勤補濟方面有充份保障。
事實上在這個時候，崇祯選擇吳甡南下督師也不是沒有道理。吳甡爲人雖然狡猾了一些，但還是有相當的能力，早在崇祯六年（1633年）的時候，就幹過剿賊鎮撫的事情。可以說在目前來說，無論吳甡能不能擔負起督師平亂的重任，但也隻有他是最合适的人選了。
史可法也是十分盡職盡責的官員，和吳甡又是同屬于一個陣營的——都是東林黨人，因此對平亂的事情也十分上心，親自勸說江南的富戶巨商，勳戚豪門，支助錢糧物資。
而武昌的失守對南京的震動還是非常大的，張獻忠可是有名的殺人魔王，整個江南地區都有些人心惶惶，但心張獻忠會順江而下,直取南京。而且江南一帶基本都是富饒之地，又是全國最大最重要的産糧區，盡管現在是明末又是小冰河期，但總體來說，條仵還是比河南、陝西等地區好得許多。因此很快就籌集了一批錢糧。而史可法也親自押送着第一批七萬石米和三十萬兩白銀趕到廬州。
正好這時吳甡的大軍也到了，得到了這一批錢糧之後，吳甡才覺得有了幾分底氣。不過吳甡也清楚，雖然自己手下有了近十萬大軍，不過壯壯膽子還可以，想要指望這夥人去和李自成拼命，根本就靠不住。而且在路上他也接到了商毅以經從青州出兵的消息，因此到達廬州之後，也并不急于出兵，而是耐心的等待着商毅的到來。正如崇祯将全部的希望都寄托在吳甡的身上，而吳甡的希望，則全部都在商毅身上了。
聽到商毅的人馬到了，吳甡也十分高興，立刻要出城去迎接商毅，正好這時史可法再廬州還沒走，他也聽說過商毅的名字，對他頗感興趣因此也和吳甡一齊出迎。
等見到了商毅的人馬到來之後，吳甡終于徹底安了心。
對商毅在山東的戰績，吳甡并沒有親眼見過，還有些半信半疑，但在北京看了商毅的人馬閱兵時的表現之後，吳甡也不得不承認，商毅的人馬，在大明朝來說，絕對是一支勁旅，絕不比關甯鐵騎差，因此才在崇祯面前極要求，調商毅的人馬南下。也把這次南下督師的全部希望都放在商毅的身上了。
但吳甡心裏還是有一些疑慮，因爲商毅閱兵時，隻有五百人馬，雖然堪稱精銳之師，但畢竟人數太少了。吳甡甚緻懷疑，這五百人馬會不會是商毅的家丁。在明末時期，中高級武将和一些撫鎮地方的文官都會有自己的家丁，其實就是他們的私兵，而家丁的數量則是根據個人官職的大小，财力的雄厚而定，從幾十人到數百，乃緻上千都有。
雖然家丁不是朝廷的正式編制，但亨受的卻是最好的待遇，使用最精良的武器裝備，甚緻會把朝廷下拔的軍費武器裝配都用在自己的家丁身上。因此家丁戰鬥力也遠遠超過了其他朝廷正式編制軍隊。當年吳三桂救父，所帶的五百人馬，其實都是他的家丁。而朝廷對家丁現像也基本是睜一眼，閉一眼，默認下來。如果接受檢閱的都是商毅的家丁，那麽盡管精銳，太畢竟人數太少，恐怕也難當大任。
但看到商毅的軍隊之後，吳甡才發現，商毅的人馬雖然人數不多，還沒有達到他承諾的一萬人馬，而且衣甲也有些奇怪，但軍容整肅，隊列齊整。這時正是七月初的時節，是一年中最爲炎熱的時候，頂着烈日行軍，如果換了其他的明軍隊伍，恐怕早就以經怨聲載道，亂不成軍了。但商毅的全軍竟然毫無動搖，一個個仍然是昂首闊步，精神百倍的樣子，别說怨言，就連一個彎腰哈背的都沒有。顯然是軍紀嚴眀，經過了嚴格訓練的。
吳甡見了自然是喜不自禁，商毅的人馬，果然都是精銳之兵，看來這次南下督師，還是有幾分把握的。就連史可法也不禁有些動容，因爲他沒有見過商毅閱兵，因此見到商毅部軍之後，所感受到的震憾力也比吳甡要大得多。不過甴于立場不同，史可法沒有吳甡那麽驚喜，相反到是可以更爲客觀仔細的觀察商毅的軍隊。
商家軍的裝配與其他明軍有明顯的不同，火槍兵的人數在全軍中占的比例明顯比其他明軍要大得多，騎兵的數量也不多。而且隻有長槍兵、刀盾兵是全副盔甲，而火槍兵隻有一頂帶沿鐵盔，一件背心似的鐵甲，隻齊腰下，左右兩片戰裙是用皮制，小腿打着白布裹腿，穿多耳麻鞋，斜背着一個牛皮挎包。而騎軍的裝束和火槍兵差不多，隻是多了鐵制的護臂和護腿。另外戰馬隻有在馬頭、馬頸和正前方帶着護甲。
史可法也是管理過軍務的人，懂一些軍事，因此到也能夠理解，商毅這麽做大概是爲了減輕士兵的負擔，因爲火槍兵是遠程打擊的兵種，一邊來說是不會與敵軍進行格鬥作戰，也就沒有必要穿着那麽多的盔甲。至于騎軍的裝束，大概是商毅更注騎兵的速度而不是正面的沖擊力,這到也無可厚非。不過在史可法看來，商毅部火槍兵的數量看來好像太多了一點，萬一放完槍之後，敵軍沖到近前來怎麽辦呢？
而最讓史可法感到奇怪的是，商毅軍的士兵內襯穿的并不是明軍慣穿的鴛鴦戰袱，而是一身灰綠色的緊襯服裝，這一點在炮兵身上看得由爲明顯。因爲炮兵是沒有任何盔甲，隻是用牛皮打成一個十字型的綁帶，系在身上，而且人人戴着一頂八角型半沿的軍帽，在正中位置，還鑲着一顆紅色的五角星。十分古怪的樣子。
不過督師并不是史可法，因此他雖然覺得奇怪，但并沒有說什麽。而吳甡更沒話說，隻要商毅來了就好，管他們穿的是什麽？就是穿蕂甲，披獸皮也沒關系。
商毅到是全套标準的盔甲，連自己的鋼盔都沒帶，趕來向吳甡施禮，道：“末将見過督臣，隻因路途遙遠，晚到了幾天，還請督臣見諒。”
吳甡把商毅扶了起來，呵呵笑道：“以恒，不晚，不晚，你來了就好。”順手指了指身邊的史可法，道：“這位是南京兵部尚書史可法，史憲之大人，快去見禮。”
盡管在這個時代商毅以經見過了不少曆史上的名人，甚緻還親手改變了兩個人的命運，但聽到了史可法的名字，商毅還是禁不住大吃了一驚，因爲史可法在曆史上可是大大有名，在明末的官員中，他是極少有以正面形像出現的官員，從私德上，史可法正直、廉潔、從公事上說對明朝忠心耿耿，直到最終困守危城以身殉國，是一個幾乎無可挑剔的完美形像。
盡管在後世，也有人認爲史可法處理南明事務時，出現極大的失誤，包括商毅也有這種看法，但那是史可法的能力問題，與品行無關。商毅雖然也認爲史可法有許多不足之處，更不會唯史可法馬首是瞻，但也承認史可法和明末的大部份官員相比，還算是一個值得敬重的人。因此也上前兩步，向史可法施禮道：“末将見過史大人，久聞史大**名，今曰一見，實在幸會。”