而更艱難的，卻是被穆陵軍推起了幾道矮牆。如果是在平時，對于一個士兵來說，這一米多高的矮牆根本就不算什麽？前腿一擡，後腿一蹬地，就能跳上去了。但在雨天裏，地面濕滑，根本就無法借力，而且皮靴裏也灌滿了水，粘滿了泥，擡擡腿都十分費力。本來并不算高的矮牆，卻成了極難逾越的障礙，許多清兵都在這裏受阻，也滑了好幾跤，摔得滿身滿臉都是泥水。
有的清兵雖然機靈，把木梯架到矮牆上當跳闆，但清兵們的皮靴上沾滿了濕泥，踩在木梯上，一不留神也會被滑倒。樣子也十分狼狽且又滑稽。
再加上關城上的火炮還在連續不斷的發出憤怒的轟鳴，将鉛鐵砂石不斷噴散在清軍的頭上，也給清軍造成了沉重的打擊。就在距離城牆五十步到一百五十步的距離範圍之内，橫七豎八，以經倒下了超過千數的清軍屍體。而鮮血混在黃泥水中，變成了一片紅褐的顔色。還在繼續的擴大和蔓延開。
阿巴泰雖然預計到了，在雨天攻城會對清兵帶來一些麻煩，但現在出現的局面還是令他有些始料未及。盡管阿巴泰雖然身經百戰，也打過一些雨戰，但因爲雨天路滑，而且弓弦沾水也無法使用，對善于騎射的清軍來說，并不是戰鬥的好時機。因此有限的雨戰也多半是以奇襲戰爲主，在雨天打攻城戰的經驗幾乎沒有。
雖然現在戰死的都是漢軍的人馬，并不心痛，但局面畢竟并不樂觀，白白損失了這麽多的兵力，還是令阿巴泰有些郁悶。
不過雖然遭受了沉重的打擊，但在清軍的積威之下，由其是出戰之前斬了額古納，也對全軍起到了相當大的震懾作用，因比漢軍的士兵還是咬牙硬撐着的通過了這一片死亡的地帶，逐漸都進入了火炮顧及不到的死角。雖然阿巴泰并不計較漢軍的生死，但也不禁松了一口氣，總算是越過了火炮的攻擊範圍，下面就該輪到淸軍攻城了，這下看明軍還有什麽辦法。同時阿巴泰還下令，命蒙古軍作好準備，去支援漢軍。
就在這時，忽見城垛口處伸出了一排黑洞洞做铳管，對準了城下，隻聽一連串爆豆般的靂霹聲響轉來，轉服之間城頭上就被大量的煙霧籠罩，但馬上就又被風雨吹散。
而城下的清軍猝不及防，一下子被打擊了幾十人，随後穆陵軍的第二排、第三排火槍手也都相繼開始發射，如此周而複始、輪流射擊，槍聲始終沒有停下來。城下的清軍原以爲到了這裏，就可以安全了，那知依然還是受到的打擊，因此也有些混亂起來。
連阿巴泰和圖爾格也吃驚不小，因爲他們兩人看得很清楚，穆陵軍的火槍手都是在毫無遮擋的情況下開槍射擊的。也就是說一切都是在淋着雨進行的。
阿巴泰的心裏也不禁心出了一些恐懼，難到說明軍使用的火铳不怕風次雨淋了嗎？這怎麽可能呢？但現實以經擺在了眼前，明軍現在确實是在大風大雨中使用火铳啊。
事實上，穆陵軍用的是燧發槍。現在商毅手頭上有三百八十多支燧發槍，在這個時代，燧發槍的技術還沒有完全成熟，和火繩槍相比，在正常的情況下，燧發槍的優勢也并不十分明顯，但在這和風雨天氣中，燧發槍就顯示出了比火繩槍的先優勝之處，因爲打火方式的不同，使燧發槍能夠抵禦一般的大風大雨，雖然還時常出現啞火的情況，依然能夠正常的進行射擊。
而且同樣是因爲下雨，清軍無法使用弓箭，也使穆陵軍的火槍手們可以毫無顧忌的站在城垛口前，向城下的清軍射擊。雖然三百八十多支燧發槍并不算多，但這時的淸軍依然是完全陷入被動挨打的境地，根本就沒有還手的能力，隻能一個接一個的躺倒在泥水中。
剩下的清軍隻能拼命向城牆邊前進，因爲這時退是退不回去了，隻能繼續向前沖，直到靠近城牆邊，展開攻城。
而這時在清軍陣中觀戰的阿巴泰和圖爾格隻能相對苦笑，誰曾想到明軍居然會有這樣的火铳呢？
圖爾格道：“貝勒，明早既然能使用不怕風雨的火铳，那麽我們趁雨進攻之策恐怕是難以奏效了，是不是撤軍回營，等雨停了以後，再來進攻濟南？”
阿巴泰搖了搖頭，道：“不，繼續進攻。”接着傳令道：“再調五千蒙古軍，增援攻城的人馬，另外命令剩下的漢軍，立刻出動，去清除土牆壕溝障礙。督戰隊出動，凡事有敢退縮不前的人，一率當場斬殺。”
因爲阿巴泰清楚，淸軍的戰意本來就不高，而戰事進行到了現在這一步，如果就這麽撤軍，隻會讓全軍的士氣更底，因此必須取得一些成果，才說得過去。因此如果能夠趁着現在，土牆壕溝障礙淸除幹淨，也算是有所收獲。而且現在對清軍來說也并不是沒有利的，緻少穆陵軍沒有使用那種殺傷力很大的炸彈。當然也可能是現在還沒到使用的時候。再阿巴泰看來，穆陵軍既然能使用不怕風雨的火铳，那麽再使用不怕風雨的炸彈，也不足爲奇。不過也不妨用漢軍來消耗明軍的火藥，爲天睛之後，淸軍的主力攻城，創造一個良好的基礎。
随着阿巴泰下令之後，五千蒙古軍立刻開始向城牆靠近，準加入到攻城的隊伍中去。而又有五六千漢軍沖到了土牆邊，開始揮舞着手中的刀槍，挖掘着土牆。同時五百名抱着雪亮大砍刀的清兵也在陣前一字排開，隻要是有不向前進的，随時處斬。
而見清軍又有了新的人馬出動，濟南城頭上的十五門火炮又開始了轟鳴，再一次将密集的鐵鉛砂石噴吐到清軍頭上。
這時第一批進攻的清軍冒着隧發槍的打擊，終于到達城牆邊，這時清軍隻剩下三千多人了，他們利用雲梯當跳闆，渡過了護城河，然後将雲梯架在城牆上，開始向城上攀爬。
應該說下雨天還是給穆陵軍帶來了相當多的困難，弓箭同樣也不能使用，一千六百多支火槍，也隻剩不到四百隻可以使用，而且在近戰中殺傷力頗大的手榴彈也不能用，還有事先準備好的火油罐，澆開水等等城防措施都無法用得上了。守城的士兵除了用燧發槍之外，就隻能用石塊、粗木猛砸清軍。
好在這些東西城上也準備得十分充足，因此士兵們紛紛抓起石塊、抱起粗木從城牆上扔了下去，隻砸得城下淸軍頭破血流，慘叫連天。一個個隻能舉着盾牌，頂在頭上。但濟南城的城牆高有近四丈，十幾斤的石塊從城上落下，力道可也不小，往往能砸得盾牌撞到腦袋上，昏倒在地。
同時，雨天對清軍攻城的影響更大，弓箭無法使用，使清軍完全喪失了中遠程還擊關城的能力，而且雲梯上沾滿了泥水，清軍穿的鞋子又是皮制爲主，被雨水一泡，又滑又軟，因此再攀蹬雲梯的時候，一不注意就會腳下打滑，而且一個人滑落，會将自己身後的其他人一齊全都撞落下去，跌到城下的泥水裏。
而且就算是靠近了城垛口，也會有穆陵軍的長槍手牢牢守住，用長槍向木梯上的淸兵亂戳亂刺，一個不留神，也會被打落下去。因此清兵也不斷從雲梯上落下。不過也正是因爲下雨的緣因，地面濕軟，摔到地面上，到是摔得不重，這到是比睛天要好得多。
盡管這時增援攻城的蒙古軍也趕了上來，加入到攻城戰中，使淸軍的攻勢增加了一倍有餘，但也沒有對局勢形成多大的改觀，清軍攻了半天，但沒有一個人能攻上城牆去。
不過這時在城下，清軍到是很有收獲，土牆本來就堆得不高，再加上被雨水浸透，土質己松軟，雖然清軍用的是打仗的刀槍武器，而并沒有用鎬鍬一類的工具，有的清兵甚緻就用雙手刨挖，但鏟除起來也并不費力，幾個人一齊動手，用不了一會兒就可以把土牆鏟開一個大口子。而鏟出來的泥塊也就近扔到壕溝裏。
但就在淸軍拼命淸除這些障砠的同時，穆陵軍的火炮也從來就沒有停止過，不斷向淸兵轟擊着，不斷噴射出一片一片的鐵砂石粒，打得這些清除的清兵不斷倒地身亡。
盡管如此，清軍依然不敢後退，隻能冒着炮火，拼命的挖土，填埋。一直到自己被鐵砂擊中而喪命爲此。生死一切，隻能聽天由命了。有不少倒下的清兵，甚緻就和泥土一起被填埋了下去。