此時太平天國将領們齊聚一堂，經常召開私下的小會。沒人對洪天王還有什麽幻想，在存亡生死的關頭，，這些将領們終于團結起來決定天國未來命運的大事。
林鳳祥無疑是首領，所以在說服天王離開天京城的事情，大家都支持林鳳祥動手，大家敲邊鼓。不過請王派李守一這件事，大家覺得林鳳祥搞的未免有些太離譜。李秀成問完，大夥的視線都落在了林鳳祥臉上。
“李守一不是我派的。”林鳳祥立刻答道。
與會的幾位王爺和林鳳祥算是同謀，林鳳祥這麽說，他們就隻能這麽相信。畢竟林鳳祥沒有必要在這等事情上說瞎話，更不用說這瞎話未免說的太過離譜。
“會不會是清妖派來的人？”陳玉成與林鳳祥走的最近，他也最先提出了自己的看法。
楊輔清不認同陳玉成的看法，他說道：“清妖現在最想的是我們和齊王打個你死我活，讓咱們去西北有何好處？”
這麽一講，衆人立刻就把滿清那邊的可能性給排除掉了。作爲這個提案的最大得益者，齊王韋澤的嫌疑就變大了不少。不過韋澤是幕後主謀的看法又遭到了陳玉成的質疑，“齊王會拿出這麽糟糕的辦法不成？”
大家一聽也覺得很有道理，以韋澤的能幹，當然能想出更有效的辦法。弄出這麽拙劣的戲碼，讓人知道了豈不是要笑掉大牙麽？
其實如果這個李守一真的能說服天王洪秀全，那自然是非常好的事情。不過這件事卻遠沒有這麽簡單，如果洪秀全就這麽離開了天京城，那說明背後會有大文章。可李守一現在被洪秀全給叫進了宮裏頭。大家想找李守一來質問都辦不到。
林鳳祥皺着眉頭慢慢的說道：“也可能是天京城裏面其他人弄出的這件事。”
衆将聽了都是一愣，接着大夥就連連點頭。的确，眼下局面誰都能看清楚，太平天國如果不立刻天京城就是死路一條。隻是衆将認爲他們才能唯一推動太平天國變化的力量，所以大家完全沒想到在天國裏面有其他人也在努力推動這件事。
“會是誰？”陳玉成立刻問道。
“這我就不清楚了”林鳳祥答道：“天國的确得靠咱們才行，不過也不能小看别人啊。”
一衆文官的名字在大夥腦海中盤旋着，隻是沒有證據，每個人看着都有嫌疑，每個人都沒有嫌疑。而林鳳祥說道：“諸位兄弟，現在也不用再想這些有的沒有的，咱們當務之急是一定要先把總參謀部建起來，把軍隊給理順。如果部隊沒有理順，咱們遠征西北得死多少人？現在齊王不會對咱們動手，如果真的動手了，咱們就是個死。所以大夥真的不要再拖下去了！”
提到這個話題，大夥的目光都落在了李秀成身上。太平軍的整編其實已經開始了，除了張應宸的禦林軍之外，林鳳祥、陳玉成、楊輔清、韋俊，這四支部隊或快或慢的都開始了整合。而李秀成、李世賢兩兄弟的部隊一直在外面單獨作戰，從來沒有過與大家整合的迹象。所以衆将都等着李秀成給出明确答複。
李秀成幾個月前回到天京城就開始吆喝要統一軍令，此時面對衆将的質詢，李秀成再沒了不久前的那股子急迫，他語氣推诿的說道：“林大哥，此事卻不用那麽急麽。我會先在我的兵裏面這麽搞，卻不用那麽着急的就與其他兄弟們的部下一起整編。”
聽了李秀成的推诿，林鳳祥也沒有逼着李秀成立刻下決定。倒是陳玉成那秀麗的臉龐上滿是嘲諷的表情。看到了陳玉成的嘲諷表情，李秀成臉上也滿是無奈，因爲林鳳祥提出的整編實在是大大超出了李秀成的想象之外。
最初的時候，李秀成以爲總參謀部制度就是多找一群幕僚，讓這群幕僚各司其職，能夠提供專業的意見。
這種體制其實對太平天國并不陌生，太平天國很早就有類似的部門。李秀成很容易就在自己的部隊裏面組建起了幕僚制度，效果麽貌似很不怎樣麽，但是李秀成覺得隻是自己的幕僚們水平有限而已。假以時日，他們肯定能夠有上佳表現。
而這一個月來，李秀成親自看到了林鳳祥、陳玉成、韋俊這三支部隊的整編。那過程可是把李秀成給吓壞了。
三支部隊裏面都有自己的參謀部，現在這三支部隊首先組建了籌備組。由籌備組選出了作戰訓練部門，對所有進行了訓練與考核。考核合格的人員就加入新組建的部隊。從聖兵向上，層層都有考核機制。每一名軍官，每一名參謀都是通過了各種考試之後選拔出來的。
自太平軍創立開始，其實師帥就不是很值錢的，手下有百十号人馬就敢成爲師帥，甚至是軍帥。按照太平天國的軍制，一師計二千六百三十人；五師設軍，全軍共計一萬五千一百五十六人。以旗幟、号衣、腰牌等表明番号。林鳳祥、陳玉成、韋俊整編之後，所有部隊全部齊裝滿員，五萬多人編成了三個軍，以及一支負責後勤運輸的部隊。
新的部隊裏頭，林鳳祥出任總參謀長，陳玉成、韋俊等人在這支部隊的總參謀部裏面出任各種要害職務。這等變化還不能讓李秀成感到震驚，真正令李秀成感到震驚的是林鳳祥對一部分不接受總參謀部制度的軍官的處置。
這些軍官們現在“身居高位”，讓他們放棄檢點、軍帥這等爛大街的名号，再去當個兩司馬，旅帥，這些人堅決不接受。還有些軍官門倒不是不接受在新部隊裏頭當一個軍官，但是他們不能接受自己再也不能當草頭王了。對這些軍官，還有依附于這些軍官的士兵，林鳳祥等人毫不客氣的把他們從部隊裏頭給驅逐出去，安排他們到天京城駐紮。
當然，李秀成參觀過新部隊。隻見這些部隊的精氣神和其他太平軍的部隊完全不同，一定要形容的話，這支部隊看起來與李秀成印象中韋澤的部下頗爲相似。
即便是看到了這樣的變化，李秀成依舊不肯答應按照林鳳祥提出的方案建立總參謀部制度。李秀成是個聰明人，他當然知道好壞，更知道林鳳祥采取的整編模式是正确的。而且林鳳祥一點都沒有藏私，他總參謀部制度的核心理念向李秀成說的明白。
兵爲将有乃是封建軍隊的特點，這首先就是上層爲了平衡下面權力的手段在裏面。一個大軍頭下面是很多并行的小軍頭，不僅小軍頭之間沒有隸屬關系，大軍頭甚至都不能侵犯小軍頭的利益，如果大軍頭開始吞并小軍頭的兵力，那将引發整個小軍頭們的集體反對。
大軍頭真正能夠指揮的動的，是他自己的直屬部隊，也就是親兵。爲了讓直屬親兵部隊更有凝聚力，更加齊心，這些直屬親兵部隊就得給與更高的待遇。當然高待遇又引發了另外的問題，那就是限于财力，直屬親兵部隊的規模無法弄得很大。
而總參謀部制度裏面，軍權、财權、人事權，統統在總參謀部手中，連參謀們甚至都不是固定的，總參謀部制度中的人員調動機制，軍官在指揮官與參謀之間來回調動，實現了對不同崗位的體會。總參謀部體制下的每一個人都不擁有私人武裝，更沒有源自私人的特權，每個人都隻是總參謀部這個制度下的一份子。
林鳳祥沒有藏私，他把這些說明的非常透徹。光這一條就讓李秀成吓壞了，林鳳祥講出了李秀成這些年統禦部隊的核心要點，更重要的是，有些要點李秀成隻是本能的去做了，卻沒想到林鳳祥除了指出這種做法之外，甚至把這些做法的内在原因都給講出來。
林鳳祥很早之前就開始模仿韋澤的總參謀部制度，據林鳳祥所說，他也是最近一年多才明白了總參謀部的真意所在。這些真正核心的内容林鳳祥他們根本不知道，在韋澤把總參謀部制度改城黨委負責制的時候，一些出于理念或者别的一些因素的人選擇了離開，離開的一部分人跑到了林鳳祥這裏。自此，林鳳祥才知道了光複軍總參謀部的真正營運理念，以及營運方法。
有幾年照貓畫虎的基礎，又得到了真傳，林鳳祥他們實施整編的時候還遭到了近半軍官的反對。而林鳳祥、陳玉成他們手段極爲強硬。反對者與反對者的支持者統統送去天京城護衛天王。天王洪秀全曾經給陳玉成兩個重要将領封王，這兩個人立刻就不知道自己是老幾了，嘗試着與陳玉成“平起平坐”，陳玉成付出了驅逐将近四分之一人馬的代價，把這兩個“禍害”和他們的部下統統送去天京城，讓他們聽候天王調遣。
李秀成自家人知道自家事，若是他也搞起總參謀部來。他手下那“二十萬”大軍能省下五萬麽？而且剩下的那些人會是精銳麽？李秀成自己完全沒有信心。
“林大哥，整編的事情還是再等等。小弟我會盡快，會盡快！”李秀成最後隻能對林鳳祥這麽說道。