會議上讨論了在今後東北抗日作戰中的一些根本問題，堅持了黨在抗日作戰部隊今後中的領導權和抗日聯軍的獨立性。會上，周保中重申了在尊重中共抗聯黨委對部隊實行獨立領導的組織原則基礎。
經研究決定把一路軍、二路軍和三路軍合并最後組建東北抗日聯軍總司令部于1939年8月成立。總司令：周保中，副總司令：張壽篯（李兆麟）、孟慶山、楊靖宇，政委：魏拯民、副政委馮仲雲，崔石源任參謀長，副參謀長汪雅臣，政治部主任李延平，副主任趙敬夫。
爲加強領導統一指揮經過讨論把中共東南滿、吉東和北滿省委的基礎上，成立了統一的中共東北黨組織特别支部局執行委員會（簡稱“東北黨委員會”），通過選舉最後的決定是，由周保中爲總書記，李兆麟、魏拯民爲副書記，成立軍事分局，孟慶山爲總書記，楊靖宇爲副書記，任命汪雅臣、李延平、柴世榮、季青、金策、馮仲雲、趙敬夫等爲委員。
經過和二路軍總部和三路軍總部會合，現在全軍總共約20000餘人，由于各地還有一些聯系不上的部隊和在南滿正在獨自作戰的一路軍。此時經過讨論研究，東北抗日聯軍總司令部下屬4個支隊和警衛旅。
第一支隊司令員汪雅臣，副司令員張中喜，參謀長王維宇，政治部主任唐永明。轄第一團、第二團、第三團。第一團由四軍的老一團組成，團長張發财，副團長王二，政委高雲清。二團團長趙富貴，副團長劉強，政委錢莊，三團王連山，副團長孫青風，政委範書豪組成。
第二支隊司令員孟慶山（兼），副司令員王文年，參謀長王光宇，政委李延平，政治部主任程文俊。轄第四團、第五團、第六團、第七團。四團團長周嶽武，副團長劉承志，政委王嘯峰。第五團團長張富甯，副團長張健敏，政委胡殿虎，第六團團長郭邴勳，副團長武志浩，政委張淩峰，第七團是由原三路軍三支隊和少量的新兵組成，團長王明貴，副團長陳雷，政委王均。
第三支隊司令員李兆麟（兼），副司令員柴世榮，參謀長張蘭生，政治部主任趙敬夫，政委馮仲雲。轄第八團、第九團，第十團。第八團由原三路軍第六支隊和部分新兵組成，團長耿殿君，副團長馮治綱，第九團由原三路軍地九支隊和二路軍七軍組成，團長郭鐵堅，副團長王效明，第十團由七軍和剩餘三路軍合并組成，團長（原七軍一師師長）王汝起。
第四支隊司令員楊靖宇，副司令員魏拯民，參謀長陳翰章，政治部主任韓仁和，轄第十一團、第十二團、第十三團。
同時下令各個支隊加強黨内建設各根據地的建設，積極開展敵後工作，團結老百姓，開展遊擊戰争，要求抗聯各部隊認真學習黨的抗日統一戰線政策和黨的戰略方針、認真研究東北抗日形勢，實事求是地制定鬥争策略靈活地做好民衆動員工作，一切有利于抗日、一切有利于黨的事業的發展。必須堅決服從東北抗聯總司令部的戰略決策，堅決完成總部下達的各項任務。
爲了更好地作戰孟慶山一邊整編部隊，以孟慶山爲主，周保中、李兆麟等人爲鋪對開展教育工作，對由周總指揮和李兆麟總指揮帶來的1500名抗聯戰士的連以上的官兵進行軍史、軍紀、軍規、群衆紀律爲主的政治教育和五大技術爲主的軍事教育，講解着怎樣開展遊擊作戰和許許多多。
因爲這一次的伏擊日軍軍列孟慶山擔心日軍的情報部門一定會懷疑這裏附近有抗聯活動，一定會派人員過來抽查，爲了以防萬一孟慶山建議到在新兵訓練完後四面出擊争取在敵人沒反應過來時先剁掉他的左臂，這樣一方面可以獲得糧食一方面也讓新兵們見見血，最後決定由抗聯總司令部帶領總部警衛旅和第三支隊向墨爾根、納河、德都、龍鎮挺進掃清敵僞勢力，打擊日軍開拓團勢力。
此時的一路軍剛剛在副總指揮魏拯民的主持下，原一路軍的第二軍四、五師在敦化漢陽溝正式合編爲第一路軍第三方面軍，指揮陳翰章，秘密休整整編。
魏拯民在木屋裏正在和陳翰章讨論三方面軍今後的作戰方向，這時外面傳來一陣聲響。
“首長、首長，二路軍發來的電文。”魏拯民的警衛員拿着由東北抗日聯軍總司令部發出的電文邊跑邊喊道。
“慢點跑，快拿來給我看看。”魏拯民一邊笑着說一邊接過電文仔細的看了起來。
“副總指揮二路軍那裏有什麽事情嗎？”陳翰章好奇地問道。
看完後魏拯民拍着大腿笑道：“當然有事，是大喜事，經過黨委的商量和讨論，把二路軍、三路軍還有咱們一路軍聯合起來組建東北抗日聯軍司令部了，而且二路軍已經和三路軍會合了。”
“回合了，那我們現在該怎麽辦？總部有沒有什麽新的指示？”
“總部命令我們一路軍改編成第四支隊，總指揮任總司令，我爲副司令員，你爲參謀長，政治部主任韓仁和，轄第十一團、第十二團、第十三團。讓咱們把成員報過去。”
“啊！那我們剛剛組建的第三方面軍不是白編了嗎？”陳翰章說道。
“沒事我們要服從組織上的安排，我看就把你們三方面軍編成第十三團吧！”
“我的老天爺啊！這不到兩天的功夫從軍的編制編成團級的了。”
“你就别抱怨了，我一會兒就走把消息告訴總指揮，總部現在命我們迅速整編部隊，三江地區挺近會合第二支隊。”
“那我們不要這裏了，我們可是經過許多年才打下的根據地，就這樣白白浪費了？”
剛才出去的警衛員又拿着一張電文跑了過來說道：“首長，首長，總部急電。”
魏拯民看了一會兒，連忙起身說道：“老陳你現在抓緊整編部隊在這裏等我消息，我現在立刻去找總指揮。”
說完急急忙忙走出屋外帶着警衛員和幾名戰士急匆匆的而去。xh211