僅京都府一地奧姆真理教的武裝分子就上百人，他們有AK-47甚至RPG這樣的軍用武器，遠遠強于警方的火力。而且明顯他們訓練有素，懂得利用地形對警察進行有效的打擊，而缺少真正巷戰經驗的警察，卻被奧姆真理教的真理軍打得七零八落，已經造成了幾十人的死傷，使得日本極大震動。
首相細川護熙得知了這一情況後，做出了批示：“在國土上非法聚衆，并私藏軍用武器，公然對警務人員進行襲擊，奧姆真理教已經嚴重危害了國家安全和社會穩定，構成了叛亂的罪行，我日本政府必将對其進行嚴肅處理！”
之前奧姆真理教畢竟是在日本合法的宗教法人，具有不能夠否定和侵犯的傳教和發展的權力，所以政府部門也沒有對其太過注意。可是京都事件以後，當日本政府開始收集奧姆真理教的各種訊息的時候，才發現自己的國家中藏了一隻怎樣可怕的怪物。
奧姆真理教幹下了大量爲非作歹的事情，包括強制關押人口，對公民的暴力侵害，甚至還與一些化學武器洩露事故有關，而随着收集來的情報越來越多，日本政府更判斷奧姆真理教組建了一個規模不清楚的武裝力量，真理軍，其心思不言而喻，就算是普通的雅庫紮暴力團也不會大量購入這些武器，而真理軍的武器甚至都包括裝甲車和導彈。
京都事件隻是一個警鍾，等于明确告訴了日本當局，奧姆真理教已經發展到了不制止就可能釀成大禍的地步了。細川護熙果斷地要對奧姆真理教進行取締，也是看出了邪教的危害。
可是，日本社會廢萌化雖然還有一段時間才能出現，但戰後的日本基本就是一個畸形的大社會。除了複雜的官商勾結和政治家族體系之外，不同政治派系、不同職能的機構互相之間也存在着種種的矛盾，推诿扯皮時有發生。
就在細川護熙代表政府發表聲明要取締奧姆真理教的時候，扯後腿的就出來了。日本最高裁判所（也就是最高法院），和一部分法律界知名人士，紛紛站出來指責政府的僭越，他們認爲奧姆真理教的宗教法人地位是确鑿的，即便是要取締，也跟政府沒有什麽關系，政府沒有權力空口白牙地取締奧姆真理教，在走司法程序、進行大量聽證之前，奧姆真理教仍舊是日本的合法宗教，政府無權對其進行任何行動。
這還不是最牛逼的，最牛逼的來自自衛隊。
細川護熙見奧姆真理教自己建立了武裝，考慮普通的警力是不可能将其拿下的，于是将這個問題抛給了自衛隊。而自衛隊方面根本不聽首相大人的招呼，陸上幕僚長，也就是陸上自衛隊的指揮官，富澤晖，拒絕執行來自首相的命令，稱當前情況埃博拉病毒疫情嚴重，大部分陸上自衛隊的自衛官處于解散狀态，一時難以召集，而且就算召集也可能帶來巨大的染病風險，這是對自衛官們生命的輕視和不尊重。同時，陸上自衛隊也對政府的指令高度質疑，奧姆真理教的定性尚未完成，陸上自衛隊不會草率地對自己的同胞平民開槍。
這一幕像極了另一個位面福島核危機的時候，日本首相菅直人命令自衛隊前往災區執行任務，而自衛隊卻像火燒屁股一樣地迅速撤離，反正不管政府怎麽懇求，自衛隊還是抗命不尊，最終熬不住，就派了兩架直升機在災區撒了點水就立即走人。
自衛隊方面不是不知道奧姆真理教組建了武裝力量，而且對社會的治安與穩定産生了負面的影響，可是自衛隊卻不敢冒着把自衛官們聚集起來進行軍事行動，而增加埃博拉病毒感染機會的風險。所以自衛隊能夠坐視奧姆真理教打日本政府的臉，而自己不采取任何的行動。
反觀奧姆真理教一邊，卻因爲京都事件的爆發，而進入了全面的整備過程中。教主麻原彰晃特地緊急召集了幾位重要的核心幹部，包括高橋克也、菊地直子、赫伯茨等人，共同商量大事。
“現在我教已經被官方給盯上了，隻不過因爲他們内部的傾軋，暫時還不會對我們形成太大的傷害，但是我們不能就此安心，日本政府早晚還是會對我們動手的，我們現在需要考慮的，是提早發動，還是再按下一段時間。提早發動雖然可以打日本政府一個措手不及，但是我們的力量還不夠強大，真理軍還有一部在國外受訓，這時候也不可能迅速形成戰力。而且我們的教衆還在各地，有些甚至是剛發展起來的地方教會，組織尚不完善，太倉促與政府作對，我們将會面臨嚴峻考驗。”麻原彰晃在這些人面前不會充得太神棍，而是說出了自己的憂慮。
高橋克也向來頗有智計，此時道：“其實不管我們準備了多少，日本政府的力量總是大過我們的，而我們一旦真的起事，雖然會遭到日本政府的全面打擊，但是對于我們更好宣傳我們的教義和力量也有幫助。這幾天随着報道，人們知道我們可能擁有解救埃博拉病毒的方法，尋找我們的基層教會企圖加入我們教會的人變多了呢！人都是現實的生物，能夠爲他們提供安全的，他們才會跟随。”
菊地直子也道：“我們也要注意，不能讓政府随意地對我們潑髒水，污蔑我們是邪教的，在輿論方面，我們必須有自己的門路，最少可以跟政府鬥個旗鼓相當，不然一旦我們的形象負面化了，人們對于我們會增加不信任，還是難以加入我們！”
兩員幹将的發言，讓麻原彰晃不住點頭，不過他們還是沒有說到底要不要全面起事，所以他又把目光看向了開發出埃博拉病毒疫苗的最大功臣，赫伯茨。
赫伯茨微微一笑道：“其實呢，現在日本政府的力量并沒有我們想象的那樣強，他們固然是官方，而且有警察、有自衛隊，但是埃博拉的出現已經嚴重削弱了他們的組織能力，自衛隊現在已經處于半解散的狀态，就算這次細川護熙的命令得到了貫徹，自衛隊想要發兵過來，也不是那麽簡單的事情。我們的人對于自衛隊的一些基地進行了摸查，防守是極爲空虛的，而且大部分的自衛官确實已經離隊了，隻有少部分的人留守在基地裏，被禁止外出，他們的軍心士氣也相當不穩定。
再者說，我們也不需要全面地與日本官方開戰，我們完全可以按照自己的策略，在需要的位置上發動攻勢。真理軍現在可戰之軍約有三千人，雖然基本上隻有輕武器的武裝，但是也是一股不小的力量了，妥善使用的話，還是大有可爲！”
赫伯茨慫恿麻原彰晃進行起義，自然背後是有齊一鳴的指使的。齊一鳴搞出奧姆真理教這麽個玩意兒來，不求把日本搞垮，但是卻想讓日本傷筋動骨。沒有什麽比一場莫名其妙的内戰更傷的了，即便是真理軍的規模不大，但自衛隊卻同樣有埃博拉病毒疫情的影響，難以發揮出十足的戰力。日本稠密的城市圈，也使得戰鬥将主要集中在城市裏，巷戰将極大地消磨自衛隊的力量，同時對于日本已經成熟和發達的經濟造成破壞，也将殺傷一定的人口。
如果再算上埃博拉病毒傳播造成的死亡，齊一鳴估計弄出一個一兩百萬的死亡，并不困難。而這麽大量人口的損失，再加上經濟和各種設施的破壞，對日本造成的創傷将是巨大的。而日本人心理的創傷也将是難以彌合，從而繼續消磨日本前進的鬥志。
等到中美攤牌的時刻，日本的力量已經不值一哂，而齊一鳴扶植起來的朝鮮聯邦，就足以對付他們了。
從這裏看，齊一鳴的整個戰略模式像一個高度和諧而且複雜的系統，一環套這一環，互相影響而互相加成，他制住遠東，統一朝鮮半島，又禍亂日本，三向使勁之下，東北亞的風雲突變，局勢大爲改觀，也造成了中國在西太平洋區域，對美國形成了絕對的優勢。
爲了支持真理軍，齊一鳴甚至不惜拿出了一些了不得的東西。之前得自神秘宮的狂化人血清，赫伯茨假裝是自己研發的也獻給了麻原彰晃，麻原對此如獲至寶。雖然這東西會将人變得人不人鬼不鬼，但是卻足夠超自然，也足夠讓普通人驚詫，更顯得他們奧姆真理教的特異。
麻原将注射了狂化人血清的真理軍戰士成爲護法金剛修羅，編成特殊的戰鬥序列，爲真理軍最核心的戰力之一。而一旦爆發了與日本政府的沖突後，這些狂化人，也足以讓日本政府在巷戰中大吃苦頭。