但在平靜的局勢之下，暗流依然洶湧，各方勢力都在積極備戰，曹軍十一月份開始便陸續向南陽和樊城增兵，使南陽至樊城一線的曹軍總兵力達到了八萬。
而天下物資雲集南陽，同樣也是從十一月份開始，曹操下令從中原及河北十二郡中抽調百萬民夫，将大量的糧食、帳篷、軍械、火油、木材等等軍需用品運至南陽，這次大運輸一直延續到次年一月，使原本庫存充足的許昌倉庫也幾乎清空。
與此同時，江夏也在積極備戰，也是從去年十一月開始，襄陽城、夏口城和武昌城同時進行加高加固，并在夏口城兩側各修建一座輔城，加強對夏口城的防禦。
而爲了支持江夏軍，陶家将位于江東九座倉庫内近三十萬石糧食，全部運到江夏充爲軍糧，并拿出一半的家産充作軍費，支持江夏軍全力抗曹。
江東方面,孫權任命周瑜爲水軍大都督、程晉爲副都督，魯肅爲長史，共出兵五萬人，戰船千艘，還是從十一月開始，周瑜率大軍在鄱陽湖内練兵。
在大軍西派的同時，江東也開始向西運輸各種軍用物資及大量糧食，以距離武昌縣不到百裏，長江東岸的蕲春縣爲江東軍後勤重地，江東在這裏修建了三十餘座倉庫，并駐兵一萬人，由程晉統帥。
随着戰争車輪不斷滾滾向前，幾乎所有人都意識到，一場關系到華夏命運的南北大戰，即将在建安十三年拉開序幕。
許都，自從幾年前曹操遷都到邺城後，許昌城便一直作爲陪都，而就在兩個月前的正月中旬，曹操爲了征伐荊州，又将天子和文武百官移到許昌，并在許昌聚天下之兵，數十萬大軍雲集許昌。
三月初的許昌城應該是莺飛草長、繁花似錦的季節，但此時的許昌卻發生了一件大事，孔子的二十世孫，北方士族領袖孔融被曹操以‘招合徒衆、欲圖不軌’之罪誅殺，此案震驚朝野，令天下一片嘩然。
許昌城内到處是巡邏站崗的士兵，不準三人同行，不準聚衆議事，所有酒館、旅舍、賭館、青樓等公衆場所一律關閉，甚至連城門口賣菜的老農們，也要相隔十步。
許昌城内被恐怖籠罩，人人自危，家家關門閉戶，天黑以後，大街上便死一般寂靜。
丞相府前更是戒備森嚴，三步一崗，五步一哨，任何企圖靠近丞相府之人都格殺無論。
書房裏，曹操正在更換朝服，在他身旁，司馬懿則在彙報太學士子的情況，司馬懿今年三十歲，在上月出任文學掾一職，負責管理官學，太學也在他職權範圍之内。
“啓禀相國，太學士子的鬧事基本已經平息了，但并不是他們偃旗息鼓，而是他們都各自回鄉了，幾天來已經走了七成，太學監舍裏空空蕩蕩。。。。。”
“夠了！”
曹操不悅地打斷了司馬懿的禀報，司馬懿立刻閉口不言，曹操又瞥他一眼，冷冷問道：“仲達，聽你的語氣，似乎也有一點不滿啊！”
“微臣不敢，隻是攔不住學子返鄉，心中慚愧！”
“要走就讓他們走，沒有什麽可惜，士族學子走了，正好給寒族學子讓路，仲達，我希望你能利用這次機會改一改太學招生徒的規矩，多給寒族學子機會，不妨學一學江夏劉璟，無論士庶，唯才是舉，這樣才能培養出真正有才華的讀書人。”
司馬懿低頭半晌不語，曹操感覺有些奇怪，又問道：“你不同意我的話嗎？”
“不！不是！”
司馬懿慌忙搖頭,“隻是....隻是我不太想......”
他說話吞吞吐吐，令曹操心中更加疑慮，“你到底想說什麽？”
“微臣不想...再管太學之事，願替丞相處理軍務。”司馬懿終于說出了自己的想法。
曹操呵呵笑了起來，“原來如此，那子廉請你做他的幕僚你爲何不去？”
子廉就是曹洪，曹洪幾次請司馬懿做他的謀主，司馬懿卻堅決不肯答應，這會兒他又想去軍中了，曹操當然明白司馬懿的心思，司馬懿是不想在這個時候得罪士族，去軍中實則爲了避禍。
不過曹操因爲郭嘉之死，賈诩投降，手中謀士不足，這司馬懿倒是有本事之人，自己幾次讓他去軍中他都不肯，難得他今天主動提出來，這不是壞事，曹操沉思片刻道：“這樣吧！我馬上要舉行南征議事，你也一并參加吧！”
.......
曹操殺孔融絕非一時興起，而是他深謀遠慮的決定，也是滅掉袁紹後必然的結果。
曹操的政治抱負是推行寒門法家，他是想利用漢末亂世的機會，打破漢朝中期以來漸漸形成的名門世家掌控潮流。
同時也要打破漢武帝獨尊儒術所形成的儒家獨大局面，重建法家的治國思想。
所以初平三年曹操殺大儒邊讓不過是試探，而今天滅勁敵袁紹後，殺孔子二十世孫才是真正地對儒家宣戰，以至于後來殺楊修，何嘗不是對其父楊彪的一次打擊。
挾天子以令諸侯不過是他爲了實現自己政治抱負的一種手段，事實上，反對挾天子以令諸侯的人主要是皇室貴族，所以有了‘衣帶诏事件’，車騎将軍董承、偏将軍王服等等，包括袁紹、劉備、馬騰，他們是曹操政治上的敵人。
而孔融、邊讓、祢衡、楊彪等等大儒名士，他并不是反對挾天子以令諸侯，如果是袁紹挾天子以令諸侯，他們說不定還會大力支持。
他們堅決反對的是曹操寒門法家的思想，他們要維護儒家士族的正統地位，不遺餘力地破壞曹操掌權的合法性，他們則是曹操思想上的敵人。
當曹操破呂布、滅袁紹、逐劉備，以及借衣帶诏事件鏟除衆多政治敵人之後，便不再容忍思想上的敵人，殺建安七子之首的孔融也就成了順理成章之事。
這同時也爲即将啓動的南征做好合法性的準備，所謂合法性，也就是敢指責他不合法的人一律誅殺，沒有人反對，他自然就合法了。
大堂之上已聚集了數十名重要的謀士武将，這就是典型的相權大于君權，朝廷隻是擺設，皇帝和文武百官也都是花瓶，真正的軍國大計卻是出自丞相府。
“丞相駕到！”
随着侍衛的一聲高呼，身着朝服的曹操在十六名帶刀侍衛的簇擁下，從側面快步走上大堂，所有人都站起身，一起躬身行禮，“參見丞相！”
司馬懿也悄悄從側門進來，站在最後一個位子上，旁邊是毛玠，毛玠對他笑了笑，他心中卻有點奇怪，司馬懿怎麽也來了。
“諸君免禮！”
曹操在自己位子上坐好，目光卻迅速瞥了一眼荀彧，也想知道自己殺孔融後，荀彧是否會來？
不出曹操的意料，荀彧果然在位，神情淡然，似乎完全沒有受孔融案的影響。
這說明，荀彧隻是保皇派而已，和孔融、楊彪等人并非同流。
曹操的目光又轉到了程昱的身上，對他點了點頭，意思是讓程昱先說，程昱一直在樊城和南陽主持戰備，三天前才趕到許昌。
他明白曹操的意思，便起身對衆人道：“各位使君，各位将軍，我先簡單說一說戰備宛城和樊城的戰備情況，從去年九月開始，丞相以舉國之力廣造戰船，現已造成大小戰船兩千餘艘，停泊在比水之上， 由五萬軍隊守衛，擊退江夏軍十餘次的襲擾。”
大堂内頓時響起一片竊竊私語之聲，誰都沒有想到，才短短半年時間，程昱竟然已經造船二千餘艘，這并不是不可能，隻是這需要調動多麽大的人力物力資源？
而且很多人都不知道，樊城的大部分船隻來自黃河和其他河流，隻是将船隻拆散後，運到樊城重新組裝，所以才可能在半年時間内造出兩千多艘大大小小的戰船。
而武将則不關心過程，造船成果令他們個個面露喜色，他們很清楚去年被江夏水軍壓制在樊城的窘迫，曹仁被迫從襄陽撤軍，就是因爲他們沒有水軍，沒有戰船。
程昱等議論聲稍稍平靜，又繼續道：“在宛城修建了一百多座大倉庫，已經屯滿糧食、軍械等物資，足夠應對一場數十萬人的大戰役，另外，從宛城到樊城的官道也拓寬夯平，使物資運送更加順暢。”
程昱詳細介紹樊城和宛城的戰備情況，曹操這時又笑道：“說說不足吧！還有哪些方面有困難。”
程昱點點頭說：“現在最大的問題是船夫不足，北方人不擅行舟，所以船夫征募格外困難，我們需要三萬船夫，實際上隻招募到三千餘人。”
曹操想了想便道：“這個問題再說吧！反正會有辦法解決。”
他又看了一眼在坐的武将，夏侯惇、曹仁、張遼、徐晃等人，其實讓他們參加議事的目的，是讓他們了解戰備情況，而商議作戰方略，還是須謀士們來決定。
曹操便對衆武将笑道：“各位勇武之士就先退場吧！我會另外召集各位商議具體作戰。”
衆武将紛紛起身退去，大堂内頓時隻剩下七八人，曹操這才對衆謀士緩緩道：“事關大局，我希望諸位暢所欲言。”